得了生殖器疱疹后要杜绝不良性生活，同时性伴侣也要同时治疗，避免交叉染。最主要还是注射增强免疫力的针剂，同时加强锻炼身体。治疗一般要保持疱疹壁完整，清洁与干燥，防止继发。
生殖器疱疹主要是保持局部清洁、干燥。可每天用等渗生理盐水清洗，告知其性伴，取得性伴的谅解和合作，避免在复发前驱症状或皮损出现时发生性接触，或更好地采用屏障式避孕措施，以减少传染给性伴的危险性。是由hsv病毒感染引发的，传统的治疗方法只能除去表面症状，无法深入病根，杀了体内病毒，所以容易反复复发。
生殖器疱疹是一种传染性极强，复发率极高，临床难治的性传播疾病，虽然是一种顽疾，但并非不治之症。治疗难点在于彻底杀毒，不留后遗症。西药起效比较快，可缓解或改善生殖器疱疹的不适症状。对重度的生殖器疱疹，尤其是反复发作、久治不愈的症状，光吃这些药基本无用。目前通过单纯性服用中药治疗生殖器疱疹较少见，通常仅用于辅助治疗，诸如一些清热解毒的中成药或草药，对临床不适症状的缓解有一定帮助。
自身要多吃营养性的食物，多吃水果蔬菜，增强免疫力。当然如果症状比较严重，那么可以采用手术治疗，药物治疗相结合的方法。首先因为生殖器疱疹是由于疱疹病毒感染导致的，因此治疗可以进行药物的治疗，也就是坚持进行抗病毒治疗。
妊娠合并生殖器疱疹的治疗方法一般有局部用药、全身用药等，具体内容如下：
1.通过局部用药可以保护疱疹的粘膜，使用生理盐水清洗阴道，使其干净、乾净。用甲紫溶液或阿昔洛韦乳膏或乳霜涂抹于病变部位，或使用酞丁安软膏。如果有明显的痛楚，可以在局部应用盐酸利多卡因软膏或口服镇痛药物，也可以将奥平的栓剂放入阴道。
2.全身用药一般建议口服阿昔韦，反复发作者应长期口服。怀孕期间要按照医生的指示服用。阿昔洛韦治出现任何其它不良反应，通常只是暂时降低嗜血因子引起的。
一般药物很难抑制，生殖器疱疹的复发率很高，西医叫不治之症。中医中药长期临床实践积累了很多独特的治疗方法，主要是要把体内的HSV病毒完全清除掉才行，要不能几个月以后又会导致复发。