很容易在后期会引发消化不良，腹胀或者是便秘，严重的时候会引起头晕失眠等。引发很多严重的并发症。肛门湿疹比较大的危害就是它会引发严重的并发症。瘙痒抓破后继发出血感染，严重者致周围蜂窝组织炎。
肛门潮湿，伴有瘙痒，以渗出为主，并有各种各样的皮肤损害，如有丘疹、红斑、糜烂、结痂、脱屑、苔藓化等变化，即是肛周湿疹或皮炎。有时肛周分泌物增多是由于肛周脓肿破溃后脓液污染造成刺激引起的皮肤反应，从治疗上，必须先治疗肛瘘，皮炎才会治好。如果不及时治疗，有可能会导致病情加重，可以出现瘙痒、皮肤破损等症状。
肛门湿疹病人要注意饮食，禁食酒类、辛辣刺激性食品，同时也要避免鱼虾等易于致敏和不易消化的食物，也要注意观察饮食与发病的关系。目前中医也可治疗肛门湿疹，中医主张辩证施治，对症治疗。中医在临床上将湿疹分：湿热症，血虚风燥症。
肛门湿疹不治疗还有可能会诱发其他疾病，比如肛门疼痛时有可能会因为搔抓破溃导致菌类感染，从而发生肛门疼痛导致便秘发生，或者是由于肛门湿疹引起消化不良，腹胀便秘和腹泻，甚至头晕、失眠、烦躁等症状。
治疗肛门湿疹应该去当地比较正规的三甲医院接受正规的治疗。大多数的三甲医院治疗肛门湿疹的效果是一样的，只有一些不知名的小医院治疗效果会比较的差劲，因为小医院的治疗手段比较少，医疗条件也是相对十分有限。