考虑是龟头炎和生殖器疱疹引起的，生殖器疱疹主要表现为生殖器出现水泡样疱疹，并伴有瘙痒疼痛等这种情况你应该到医院做相关检查，根据不同的情况采取不同的治疗方案。
生殖器上长了小水泡如果因为过度摩擦或者过度刺激引起张力性的水疱，可使用碘伏溶液进行局部消毒，水疱较大者可采用无菌的注射器，将水疱内的疱液液抽吸干净即可，停止相关的刺激后水疱可逐渐消失。一旦症状加重，患者应该尽早前往医院，在专业医生的指导下进行治疗。平时少吃辛辣刺激的食物，忌烟酒，保持充足的睡眠，少熬夜。
一般情况下，男生生殖器上长了小水泡，可能可以在医生指导下吃阿昔洛韦片、伐昔洛韦片等药，具体内容如下：
如果不洁性生活导致男生受到了生殖器疱疹的影响，一般会导致生殖器上长出小水泡，可以在医生指导下服用阿昔洛韦片、伐昔洛韦片等抗病毒的药物，通常在两三个星期后，就可以抑制这种病菌的生长，有助于消除生殖器的炎症，同时还可以外用阿昔洛韦软膏等药物。
一般情况下，生殖器上有小水泡可以通过使用药物、物理疗法、日常护理等方式缓解相关症状。具体内容如下：
1.使用药物：如果患者的生殖器上有小水泡，可以及时就医，在医生指导下使用阿昔洛韦片、溴夫定片、膦甲酸钠乳膏等药物进行治疗。
2.日常护理：患者还要注意休息，避免过度劳累，平时要注意生殖器部位的清洁卫生，选择材质好、柔软的内裤。
如果生殖器上出现小水泡，建议通过以下措施改善：
1.首先要考虑是生殖器疱疹病毒引起的性传播疾病；
2.需要到正规医院泌尿外科抽血化验疱疹病毒抗体才能明确诊断；
3.一旦确诊，需要局部涂抹抗病毒药物，比如阿昔洛韦软膏，治疗一两周。
4.治疗期间可同时口服病毒唑口服液等抗病毒药物，帮助进行杀菌处理。
生殖器上面长小水泡属于异常情况，建议患者及时就诊，对症治疗。