男性生殖器隐睾是属于先天性的，可以通过手术来治疗。手术后要保持会阴部伤口敷料清洁干燥，被染湿时应及时通知医护人员更换，防止切口感染，伤口疼痛剧烈时，可用深呼吸，呵气等方法减轻疼痛。
隐睾恶变，必须要尽快做手术切除隐睾，避免对身体形成严重的伤害，避免发生转移现象，手术以后还需要使用化疗药物治疗，这样才能够恢复的，如果发生了转移现象，就很难彻底完全治好的，现在只能尽力治疗，可以使用一些中医中药治疗，避免疾病的加重。
隐睾可影响精子生成，导致不育，并且发生肿瘤的几率也会增加，如诊断为隐睾像年龄建议及早进行手术治疗，确诊隐睾手术治疗方法确切，术后抗炎，对症，定期换药，可以治好，约三周治好。
婴儿出生时睾丸已下降入阴囊，但也有一部分婴儿，由于胚胎发育延迟的缘故，睾丸的下降时间可以推迟到出生后3个月到1年。因此，如初生时婴儿有隐睾，可不必急于采用药物或手术方法试图将隐睾复位，双侧隐睾在2-3岁时纠正，单侧稳睾在5-6岁时纠正。
隐睾症这种疾病早期可以吃激素药先治疗一下。激素用于治疗隐睾受到普遍重视。用于治疗隐睾的激素，主要有绒毛膜促性腺激素(HCG)、黄体生成激素释放激素(LHRH)和促性腺激素释放激素(GnRH)。绒毛膜促性腺激素主要成分是黄体生成激素(LH)，LH刺激间质细胞，产生睾酮。治疗时会出现阴茎增大、睾丸胀痛的情况。