输精管堵塞不是一个独立的疾病，而是多种疾病造成的一种症状。治疗时首先应针对原发病治疗，如抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，个别情况下可直接从附睾处吸取精子进行人工受精，及时去医院做相关检查如应进行精液生理及生化检查。
输精管堵塞是可以治好的。输精管不通造成的男性不育症，精子和卵子不能结合了，造成的不育症。输精管从睾丸、曲细精管，到附睾，到输精管、射精管，是非常长的一个管道，在任何部位，出现了问题，都有可能造成输精管的梗阻。
输精管堵塞，首先可能会造成男性的不育，因为精子不能通过输精管排出。另外，会造成睾丸的萎缩，还有就是会引起并发症，比如睾丸缩小等。另外，还会对病人的心理造成很大的阴影。
输精管堵塞手术后是很容易复发的，如果复发治疗办法也有很多。首先去除原发病因，对于感染因素造成者先抗感染治疗，再考虑再通手段。肿物切除术。精索、精囊、前列腺肿瘤或囊肿，或者周围其他器官肿瘤、囊肿产生压迫者，可行手术切除。输精管附睾吻合术。病变在附睾尾部，可行输精管附睾吻合术输精管吻合术。如果梗阻在输精管，可行梗阻段切除，输精管端端吻合术。经尿道射精管切开术。适用于射精管梗阻者。
治疗输精管堵塞首先要看以前是否做过结扎，或是以前是否有炎症而引起了梗阻，另外还要看梗阻的部位和长度。如果是结扎引起的，那么手术部位就比较明确，可以做显微手术进行疏通。如果是结核引起的，那么手术可能无法达到要求，可以对睾丸附睾进行穿刺取精，进行辅助生育。
输精管的堵塞一般就是采用手术治疗，其中的输精管吻合术对治疗输精管堵塞的效果更好，也可以通过显微镜手术，找到梗阻的部位，将梗阻部位切除以后，疏通缝合，能够达到疏通的作用。