抗生素治疗，对于肺脓肿要做到早期，有效和彻底地给予抗生素类的药物的治疗。切除治疗术，早期肾穿刺造瘘?，充分引流，若肾功能恢复?，则矫治梗若，功能?不能恢复，且对侧肾功能良好者，应行患侧肾切除术。
切除治疗术，早期肾穿刺造瘘?，充分引流，若肾功能恢复?，则矫治梗若，功能?不能恢复，且对侧肾功能良好者，应行患侧肾切除术；抗生素治疗，对于肺脓肿要做到早期，有效和彻底地给予抗生素类的药物的治疗。
肾脓肿的治疗，应该先判断感染的病原体，然后选择合适的药物治疗，疗程通常要半年以上，需要配合做引流治疗，治好后，多不会复发。另外平时饮食要清淡，不要吃辛辣刺激的食物，注意合理睡眠。
肾脓肿多和细菌感染有关的，如果是普通的细菌感染，则属于比较容易治好的，如果是结核分枝杆菌所致的改变，则治疗比较困难的，疗程通常要半年以上的，这种疾病的治疗，应该先判断感染的病原体，然后选择合适的药物治疗的，多需要配合做引流治疗的，治疗后，多不会复发的。
药物治疗结合早期的引流。传统的治疗提倡切开脓肿引流，在超声或CT引导下经皮穿刺安置适当大小的引流管也可以。如经皮引流无效时，必须及时切开引流或作肾切除术。对于肾周脓肿来说，仅用抗生素治疗是不够的。