药物治疗结合早期的引流。传统的治疗提倡切开脓肿引流，在超声或CT引导下经皮穿刺安置适当大小的引流管也可以。如经皮引流无效时，必须及时切开引流或作肾切除术。对于肾周脓肿来说，仅用抗生素治疗是不够的。
可以治疗好。治疗方法有：手术治疗，一般可采用囊肿去顶减压术，此手术减轻了囊肿对肾实质的压迫，保护了大多数剩余肾单位免遭挤压和进一步损害，使肾缺血状况有所改善，部分肾功能单位得到恢复，延缓了疾病的发展。穿刺治疗，主要是在B超的引导下进行一个穿刺把囊液抽掉，用无水酒精来处理囊壁。另外可以做腹腔镜微创的肾囊肿的去顶，它切掉大部分囊壁，抽掉囊液。
肾脓肿多和细菌感染有关的，如果是普通的细菌感染，则属于比较容易治好的，如果是结核分枝杆菌所致的改变，则治疗比较困难的，疗程通常要半年以上的，这种疾病的治疗，应该先判断感染的病原体，然后选择合适的药物治疗的，多需要配合做引流治疗的，治疗后，多不会复发的。
白酒，对于多囊肾病人来讲宜戒掉，酒类对与肾脏的刺激性优为重要。避免高蛋白食品：每一种肾病，都应该低蛋白饮食，避免体内氮类代谢物合成，减轻肾脏的排泄力。如大豆、豆腐、以及其他豆类制品。适当的锻炼身体以增强体质。饮食上要少喝酒及刺激性、高脂肪的食物。
肾囊肿饮食应忌辛辣刺激类：如辣椒等；忌酒类、吸烟包括被动吸烟；忌巧克力、咖啡、海鱼、虾、蟹等发物；忌过咸的食物，如大豆、豆腐、以及其他豆类制品。适当的锻炼身体以增强体质。饮食上要少喝酒及刺激性、高脂肪的食物。