多性肾结石的治疗方法可以通过手术治疗，但是如果结石也比较小，可以观察一段时间，先不用特殊处理，如果已经有了症状，造成了血尿，蛋白尿或者是肾功能的不正常。可以手术进行缓解。
多发性肾结石可以通过手术进行治疗。感染性肾结石最常见的就是外科治疗，因此，一旦诊断出肾脏结石，要尽可能的进行外科治疗，但是要知道，外科治疗也有一定的适应症，肾结石的病人要知道这一点。对于那些在短时间没有排出的肾脏结石，如果肾脏的直径小于0.8cm，可以考虑用药，但是如果是肾脏的功能比较好，而且不会出现明显的炎症，如果结石的体积大于1cm，建议立即进行外科治疗。
多发性肾结石是比较严重的，多发性肾结石首先要看结石的大小和位置，如果结石很大或者卡在了输尿管等地方是可以造成肾积水的，严重的还会对肾脏功能造成伤害，所以肾结石是需要引起重视的。
双肾多发性肾结石可以通过以下方式进行治疗。
一，结石具体部位结石有多大、结石数量，肾是否正常，根据对以上情况的认识，做出处理上的抉择。如果结石没有位于肾盂和肾盏中，可以不进行治疗，石低于0.5厘米的，应进行排石治疗，结石在0.5~1.5厘米之间时，可用体外震波碎石。当结石大数量较多或者肾功能不佳时，选择手术，体外震波碎石处理是损伤很小的处理手段，把结石震碎，靠尿流排除，治疗痛苦少，通常都可以忍受，一排石需要尿液清洗，需要具备良好肾功能。
日常生活注意，一天的饮水量约为三千毫升，不宜喝果汁，茶和碳酸饮料等，以免含钙过高、限制食盐和糖的高草酸盐膳食。
一般情况下，有多发性肾结石应该注意调整饮食、适当运动等方面，具体内容如下：
1.调整饮食：如果患者患有多发性肾结石，患者应注意调整饮食结构，要做到饮食平衡，要尽量避免吃高嘌呤、高钙、高草酸等食品，以免加重病情。
2.适当运动：患者可以适当进行运动，可以通过跳绳、爬楼梯、跑步等方式来帮助体内的结石排泄。
要明确结石形成的原因，如长期不能规律饮水、久坐或者有憋尿的习惯，要改掉这些不良习惯。其次，到医院救治，如两侧肾都有结石，选择治结石较多的一侧，保留结石少的，目的是保存一定的肾功能。可以通过碎石治，也可以通过放入输尿管支架取石治。