如果已经确诊是霉菌性尿道炎，往往会有真菌培养的以及药敏的试验结果，通过药敏试验结果来选择一种敏感的抗真菌药物服用即可。所以如果男性出现霉菌性尿道炎，女方也要去医院检查是否存在霉菌性的阴道炎。如果女性是霉菌性阴道炎，需要同时治疗。霉菌性的尿道炎可能是，继发于长时间服用广谱抗生素的之后发生，可以在情况允许的条件下停用抗生素。
霉菌性尿道炎可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善。
霉菌性尿道炎是一种比较少见的疾病，主要是由于长期服用抗生素，或是在抗生素中不合理的使用而引起的。这是一种孩子的传染病。如果是霉菌性尿道炎，需要做尿检，尿液中有孢子，也有尿培养。如果尿道炎的症状不严重，可以停止使用抗生素，同时使用抗霉菌的药物，目前临床上使用的主要是大扶康，一般在治疗三天之后，要及时复查尿常规，检查尿常规有无霉菌孢子。
霉菌性的尿道炎主要是由于人体免疫力低下，这种真菌机会性感染尿道黏膜而产生大量的繁殖出现的尿路感染，可以药物进行治疗，并且要补充足够的水分可以促进治疗。
霉菌性尿道炎的病人应该及早到医院进行身体检查，针对性的治疗疾病。平时多注意身体保健和个人卫生，自己的内衣裤应该单独的清洗，如果出现了疾病也可以选择使用口服抗生素药品进行治疗。
这种尿道的炎症反应会出现尿频尿急，甚至有尿道分泌物的现象。到专业的泌尿外科来检查尿常规和尿中的分泌物，做细菌培养加药敏试验，这样才能有针对性的用药，一般在两周左右是可以恢复正常的。
霉菌性尿道炎如果偶然发生，尿培养确诊为霉菌感染，就口服药物一周。如果是反复复发的霉菌性尿道炎，女性一般与身体抵抗力弱、口服抗生素、与其性交的男士包皮过长有关，必须去除这些病因，多吃新鲜水果蔬菜、多吃牛羊肉、海参，增强体质。发生疾病时不要滥用抗生素，建议男士割掉包皮。