肾结石在治疗时通常包括药物排石、体外碎石和手术排石等排石方法，临床可根据结石的大小来选择合适的排石方法，一般直径小于6毫米的结石多选择药物排石，如中药的排石冲剂和西药；6毫米到2公分之间的结石可以选择体外震波碎石，如结石过大可选择经皮肾镜和输尿管软镜碎石，或选择开放性手术进行排石。
需要卧床休息，减少活动，多饮水，促进尿液的稀释。如果出血量较大，可以选择使用止血的药物来进行治疗。肾结石发生尿血，是由于结石活动而导致泌尿系黏膜受损，黏膜受损后出现破裂出血而形成血尿。
如果孕妇肾结石的病情是轻度的，可以多饮水，减少散步的次数，增加身体的代谢速度，从而加快体内的代谢，从而加快排泄。
如果怀孕期间出现了肾结石，建议到医院进行B超的诊断。如果石头不超过2公分，建议多饮水，每天适量的锻炼，避免草酸类的摄入量。在生产完成以后采用震波进行体外碎石。如果结石比较大，可以在生产后进行外科摘除。
肾结石应该进行手术治疗。肾脏结石需要根据结石的位置、大小及是否造成肾脏积水等多因素决定如何治疗。最常用的治疗方法是体外冲击波碎石。肾脏结石在2厘米以下的首选治疗方法，体外冲击波碎石无任何创伤。经过体外冲击波碎石后，需要定期进行观察随访，直至结石完全击碎排出为止。如果经过体外冲击波碎石治疗后的肾脏结石，没有任何的排出和改变，则可以选择手术治疗。
肾结石如果是比较小的结石，可以采取药物排石的方式进行治疗。注意多饮水，多饮水可以增加尿量，稀释尿液中晶状物质浓度，减少结石的发生。排尿的过程还可以使一些小的结石随尿液排出体外。
