附睾炎的治疗要选择对细菌敏感的抗菌药物，对症消炎止痛。酌情采用附睾切开减压或附睾切除术。急性附睾炎症状可于一周后逐渐消退。慢性附睾炎反复发作可影响生活质量和生育。
附睾炎是很容易复发的，尤其是抵抗力下降的时候，但同时也是可以治好的，需要在出现急性炎症反应的时候规范，吃足够疗程的抗生素治疗，如果治疗不规范，极易形成慢性附睾炎。
附睾炎中医治疗是不如西医效果好的，对于急性附睾炎，应选择对细菌敏感的药物，通常静脉注射1到2周后，口服抗菌药物2到4周，预防转变成慢性炎症，如果抗生素药物无效，怀疑有睾丸缺血，进行附睾切开减压，纵向或横向多处切开附睾层鞘膜。
抗菌药物可以用于治疗。结合热疗，有助于缓解症状和促进炎症。刚洗完澡，高温可能会加重疼痛，并有促进感染扩散的风险。冰袋、局部冷敷等的早期应用。如果发生慢性睾丸炎，广谱抗生素结合局部理疗可以帮助缓解症状。
附睾炎的治疗卧床休息，应用阴囊托或自制的软垫托起阴囊可减轻症状。疼痛重者可用止痛药，局部热疗可缓解症状，并可促进附睾炎的治疗。到正规三甲医院就诊。应用阴囊托可减轻症状，自制较大的带棉花垫的阴囊托使用起来会更舒适。