一般来说，怀孕三个月肚子右侧隐隐作痛可能是由于子宫增大所导致的。
孕妇在怀孕三个月左右会出现腹部的轻微疼痛，这是生理上的，也有可能是病理性的。如果是由于子宫增大，牵连到一侧的韧带，会产生牵拉性疼痛，需要考虑生理因素。这种症状会随着时间的推移而逐渐消失，不用太过紧张。长期没有好转，可能是肠炎、泌尿系结石、先兆流产、阑尾炎等疾病引起的。
怀孕三个月右边肚子隐隐作痛可能是子宫增大、先兆流产等症状引起的。
孕妇右侧腹部有轻微的疼痛，主要是由于胎儿生长过程中的子宫扩大，拉伤了一边的韧带，造成了一定程度的疼痛症状，但随着胎儿的生长，会逐渐好转。腹痛也要看是否为进食引起的肠道炎症以及是否有预兆的流产，因此如果疼痛没有减轻，建议到医院进行彩超检查。
怀孕腰痛的原因如下：
首先可能是有宫缩的迹象，因为有的人宫缩通常不表现在肚子疼，而是表现在腰部不适。还有一种随着孕周的增加，孕晚期腰部负担比较重，有腰酸背疼的感觉。但也有可能是孕期为维持子宫位置，腰椎前突，腰肌及背肌紧张，诱发肌肉劳损，导致腰背痛。同时也有可能是腰椎间盘有问题，就是本身腰部局部的问题。
怀孕后左侧疼痛的原因如下：
一、有些孕妇左侧疼是因为过度劳累。部分女性由于孕期长期加班或休息时间不足，导致胎儿发育不良。如果胎盘与胚胎的连接不紧密，就会发生先兆流产，所以女性会出现左肚子疼痛，可能会导致阴道出血。
二、饮食不当会导致孕妇左侧腹痛。如果女性在怀孕期间没有保持良好的饮食习惯，经常暴饮暴食或者吃一些生冷刺激性的食物，就会因胃部受到刺激而患上肠胃疾病，比如肠炎、胃溃疡或者肠胃绞痛，所以女性会出现左胃疼痛。
怀孕31周肚子隐隐作痛、腰痛可能是多种原因导致的，具体分析如下：
这是一种正常的生理现象，到了妊娠后期，子宫会越来越大，身体也会发生相应的改变。在妊娠期间需要补充足够的钙，并且由于胎盘分离松弛手术，骨盆韧带、椎间关节、韧带松弛，造成耻骨粘连松弛，或出现腰痛、下腹坠胀等症状。还有一些是宫缩引起的，要仔细观察，如果出现了阵发性宫缩频繁的情况，还要做宫颈管的长度，如果是先兆早产，就要住院保胎。
怀孕三个多月，小腹部有不适的症状，考虑是饮食不佳或受凉引起的症状。平时多注意休息和保暖，避免劳累，及时去医院检查，明确病因，平时要多喝热水，多吃蔬菜，忌生冷辛辣刺激性的食物，保持良好的心情。