如果畸胎瘤大于3厘米，应该及早手术。手术可采用腹腔镜或开腹手术。现在多使用腹腔镜手术，卵巢畸胎瘤因肿瘤为不均质性，容易发生肿瘤的扭转，一旦扭转必须急诊手术的方式治疗，多数症状下需切除扭转一侧的附件。
畸胎瘤是需要做手术治疗的。畸胎瘤在临床上分为畸胎瘤和未成熟畸胎瘤，那么成熟性畸胎瘤属于良性的肿瘤，未成熟畸胎瘤属于恶性肿瘤，所以如果发现了畸胎瘤，要及时的给予手术治疗。
可以继续观察为主，若畸胎瘤没有继续变大，可以保持观察。若有变大，或者引起腹痛，需要手术切除。畸胎瘤是临床上常见的肿瘤，根据肿瘤良恶性分为良性畸胎瘤及恶性畸胎瘤。
畸胎瘤是一种常见的妇科肿瘤，有良性也有恶性，良性畸胎瘤多见，是良性还是恶性，这要等手术后病理切片结果出来后才能确诊。一旦确诊为畸胎瘤，无论是良性还是恶性都要及早的手术切除，一般说来未成熟性畸胎瘤的预后效果较差，手术无法保证彻底，干净的消灭。
畸胎瘤是来源于卵巢生殖细胞的肿瘤，大多为良性，但有恶变的可能，较大的畸胎瘤可以发生蒂扭转、破裂和感染引起急腹症。目前没有药物能消除这么大的肿瘤。可靠的治疗方法就是手术。