一般情况下，怀孕初期小便后纸上有褐色分泌物意味着先兆流产、宫外孕、尿道炎、尿道结石等问题。具体分析如下：
怀孕初期，小便后纸上有褐色分泌物，要注意观察是否有血液从阴道或尿道口流出。从阴道排出，通常是阴道内有不正常的流血，这是先兆流产，也有可能是宫外孕导致的。但是，从尿道口流出来，可能是尿道炎或者是尿道结石引起的。
一般来说，怀孕初期小便后纸上血可能有以下原因：
1、受精卵着床或先兆流产都有可能引起阴道少量流血的情况出现，建议定期前往医院做常规的妇科B超孕检，同时在医生的指导下口服保胎药物。
2、泌尿系感染也可能导致小便后纸上有血的现象。建议产妇尽早前往医院就诊，明确病因后对症治疗。
此外，建议孕妇在日常生活中，定期到医院做产前检查，还要注意饮食健康，多吃新鲜的蔬菜和水果，保证营养均衡，多注意休息，避免劳累，保持心态平和，有利于身体健康。
怀孕期间出血的话可能是先兆流产的，要去医院检查，胎儿是否正常。要注意休息，合理饮食，腹部保暖，增加全面的营养，保持良好的心情，不要有过大的压力，不要同房，有利于胎儿的健康成长。
怀孕初期分泌褐色分泌物，其实就是出血，因为血液在阴道内留存后氧化而变成褐色，出现孕早期出血的因素很多，有几个方面，子宫腔内出血，是先兆流产的症状，宫颈出血，比如有宫颈息肉、宫颈柱状上皮外翻，甚至宫颈癌会有出血，需要孕前进行宫颈的防癌筛查。
怀孕早期出现褐色分泌物，可能是由以下几个原因导致：
1.受精卵刚着床引起的着床出血表现，一般出血量比较少，而且在1-2天左右可以自然干净。
2.考虑是孕激素偏低导致的先兆流产现象，常会伴有小腹隐痛，而且查血HCG和孕酮会发现孕酮偏低，这时就需要进行保胎治疗。
3.考虑是受精卵没有在宫腔内着床，而在宫外着床导致的宫外孕征兆。这时的褐色分泌物会持续出现，而且伴有下腹部的持续疼痛，在宫外包块破裂的时候，就会引起剧烈的腹痛甚至是失血性休克。建议及时到医院进行手术治疗。
怀孕初期分泌褐色液体，数量不多，可以先观察。怀孕期间要注意休息，不要做太激烈的活动。妊娠早期出现棕色的粘稠液体，需要注意是否有阴道流血。
要做好妊娠前的HCG检测，看看有没有妊娠，再看看是否为宫内妊娠。出现宫外孕要及时治疗。如果是宫内妊娠，建议做一些孕酮等方面的检测，以保证在子宫里的胎儿能够健康的生长。妊娠早期出现棕色的液体，要及时就医，由医生来诊断，不能掉以轻心，不要掉以轻心，同时还要多加休息，避免出现先兆流产。