输卵管囊肿是妇科疾病中的一种，如果输卵管急性期炎症没得到及时有效的治疗，就形成了输卵管积脓。严重的可造成女性不孕，如果治疗不及时，诱发其病情恶化，就容易导致女性的不孕。输卵管囊肿会对生育造成很大的影响。
卵巢囊肿的危害还是挺大的，其中之一就是可以导致不孕，影响生育。一旦卵巢囊肿变大或者变性，就有可能使精子、卵子或者受精卵不能正常运行，从而影响生育，导致不孕的恶果。最严重的是发生癌变，威胁生命。卵巢囊肿增大极易发生感染、扭曲、出血或爆裂，只要积极治疗，这种疾病就不算严重。如果治疗不及时，可引起不孕不育症。
有输卵管积水和巧克力囊肿，首先输卵管积水可以阻碍精子和卵子的结合，造成不孕，需要在腹腔镜下做输卵管疏通术，同时做巧克力囊肿挖出，保留卵巢就可以，这两个手术是可以同时进行的。
输卵管有囊肿，要看囊肿的大小有没有影响到输卵管排卵。如果囊肿比较小可以定期复查，观察囊肿是否有变化。如果囊肿生长的速度比较快，或者囊肿比较大，超过了5cm，就需要进行手术切除治疗。给带来生命的威胁。有些瘤性的囊中甚至会发生癌变。
对于严重与否，主要是看其体积大小而定，如果其囊肿比较小，对其附属于器官没有造成影响，如果疼痛，或是功能障碍，可以不用治疗，注意观察即可。如果囊肿体积比较大，有症状表现，如局部疼痛，功能障碍等，则需要进行手术治疗，对内脏部位的囊肿可以选用微创手术治疗，其手术对身体影响小，其治疗效果比较好。
输卵管系膜囊肿是指输卵管受病原体感染以后，由于白细胞的浸润，形成内膜肿胀，间质水肿的症状，主要是炎症性的表现。如果得了输卵管系膜囊肿，囊肿比较小，一般不需要通过手术治疗，可以考虑药物消炎治疗，定期复查。