怀孕两个月发烧胎儿畸形不绝对的，但是在怀孕期间出现发热等多属于护理不好或者伴随感染等影响的，可能会有一定风险的，能不用药就尽量不要用药。可以做个产检看看。也要加强营养，多喝点白开水看看。这时期还是要多注意休息。
有一定的影响的。在妊娠早期也就是妊娠十二周以内，这个时期是胚胎各个脏器系统器官发育的关键时期，对外界的不良因素，包括有毒、有害的物质、药物、放射线等的敏感性也是比较强的，也就是外来的不良因素造成胎儿畸形的风险是比较大的，因此在这个时期，一旦有发现异常的现象要及时就诊。
如果是低烧，例如体温在38度5以下，一般来说不会对胎儿造成明显的影响。
人属于恒温动物，只能在适宜的温度下生存和繁殖，当体温升高到一定程度就可引起一系列生理上的改变，尤其是像胚胎细胞这样分裂旺盛的组织，对温度升高极为敏感。在怀孕5-6周(从末次月经第一天算起)期间，即神经管发育期，若孕妇的体温高过38.9℃，且持续超过24小时，就会增加胎儿发生神经管缺损(如无脑儿)的机会。在高温环境下，物理性有害因子会杀死早期胚胎中正处于分裂的细胞，使该组织停止发育，造成畸胎，严重的可致胚胎死亡。
孕妇发烧，如果体温高于38.5度，要去医院开一些不会影响胎儿发育的退烧药。如果低于38.5度，采用物理降温就可以了，可以泡一个热水澡。
怀孕发烧一般对孩子影响不大，不要过度紧张。平时多喝白开水，防止身热引起的脱水现象。用温湿毛巾擦拭额头和手脚心等部位，或者是在腋窝和腹股沟等部位进行冷敷，同时注意多喝温水和排汗，促进身体新陈代谢。
女性在孕期出现发热症状时可以通过物理退烧和药物来进行退烧。
1.物理退热：妊娠后体温低于38.5摄氏度时，可以用温水或乙醇擦拭颈部、腋窝、大腿根，也可以用冷毛巾包上冰敷腋窝等，一般2-3次即可。
2.用药来进行退烧，妊娠期间体温38.5℃或更高时可以使用对乙酰氨基酚进行退烧，同时要警惕恶心、呕吐、出汗、腹痛、皮肤苍白等不良反应，也有少部分患者会出现过敏性皮炎、粒细胞缺乏、贫血、肝功能损害等症状。对该药物过敏的人不要使用。
怀孕早期发烧对胎儿有可能造成影响：
怀孕早期是孕妇免疫力最低的时候，这个时间出现发烧等情况，是有可能对胎儿也造成一定的影响的。但是只要症状不严重或者持续的时间不长，一般对胎儿的影响不大。孕妇出现发烧的情况，可以先通过物理降温的方法来缓解症状，比如温水敷额头或用适当浓度的酒精擦拭。如果症状一直得不到缓解，需要及时到医院进行检查，再根据医生的建议进行治疗。