小儿发育迟缓病因很多，有的属自然过程，有的属遗传因素，有可能存在染色体畸形，更多的则属病。
可能与孕期母体营养的供应有关，也可能是脐带或者是羊水病变引起的。部分显示出家族矮身材、体质发育推迟，也有出生体重性矮小的，这都与遗传，宫内发育不良等因素有关。需积极寻找病因，补充营养，使用药物促进胎儿生长发育。
胎儿发育迟缓有两方面的原因，一方面是孕妇的原因，另一方面是胎儿的原因。胎儿生长发育迟缓指的是胎儿体重低于其胎龄平均体重的第10百分位或低于其平均体重的2个标准差。如孕前体重低于54kg，妊娠时体重过小或过大，发生胎儿宫内发育迟缓机会均增高。如果胎儿患有遗传性疾病或染色体病史，胎儿宫内发育迟缓出现时间会较早，如染色体数目和结构异常，以21、18、或13三体综合征，Turner综合征等较为常见。
胎儿发育迟缓指的是胎儿的体重明显的低于与同龄胎儿平均体重的一种表现，是妊娠期最常见的并发症。导致胎儿宫内发育迟缓的原因，有可能来自于母体，胎儿，脐带，羊水或者胎盘。
一般情况下，孩子发育缓慢的病因有很多，有遗传的，也有可能是在孩子的生长中出现了一些问题，也有一些是因为孩子的身体素质差，没有足够的精力来进行生长。如果发现孩子比其他年龄段的孩子要慢一些，建议立即去做一些身体的器官和微量元素的检测。首先要明确病因，饮食要平衡，要多吃些补钙、维生素、鱼肝油等，多让孩子多户外运动，可以促进身体的发育。
发育迟缓是小儿常见病，多数表现是里程碑障碍，如3个月抬头、4个月翻身、6个月会坐、8个月会爬、10个月会扶站、12个月会走。有部分患者里程碑会比这个延迟。主要是看延迟多少、肌张力的障碍程度，如果是脑发育障碍引起的，需要用一些促进脑发育的药品；如果是肌张力障碍比较严重，需要康复治疗。康复训练包括水疗、TTOT理疗，这些可以根据患者的病情做一些调整。
妊娠前期胚胎生长缓慢主要是由于胚胎自身发育不良，夫妇两个染色体异常，男性精子品质差，或者患有妇科炎症，或者孕酮偏低，或者在妊娠前期，由于接触了太多的有毒、有害的物质或者X线，造成了胎儿的生长不良。
但是也有人认为这并不是因为发育缓慢，而是因为怀孕后期，如果按照末次月经计，那么孕周就会和B超上显示出来的时间不一致，会被误认为是发育缓慢。