妊娠六个星期看不到孕囊是不正常的。
女性的月经周期28-30天是正常的，停经35天，B超可以在宫腔中看到一个小的孕囊，妊娠6个星期的时候，孕囊的大小可以是2cm,10周的时候大约5cm。孕囊位于子宫的最下面，前面，后面，上面，中间，都是正常的。
女性在月经期间，如果女性的月经延迟，就会导致女性的排卵后错误，怀孕的时候也会不稳定。所以怀孕的时候会有孕囊比实际停经的时候少，如果是在五十天之后，怀孕的时候会发现孕囊有四十多个小时，这个数值就会变得很小。一般是因为怀孕的时候，子宫内的绒毛膜促性腺激素和孕酮数值会慢慢升高，孕囊会持续增长，同时还会有胎芽和胎心。
停经30多天后，验孕棒和绒毛膜促性腺激素都显示有妊娠迹象，停经6周后仍看不到孕囊，说明有宫外孕的可能。
看不见孕囊并不代表着是宫外孕。
看不见孕囊，可能是因为停经的时间比较短，孕囊还没有在宫腔内完全的生长出来，就会出现看不见孕囊的情况。可以在停经过后的40天到医院进行B超检查，能够根据检查的结果看到宫囊内有孕囊的出现。如果50天之后在宫腔内没有看到孕囊，就要考虑是宫外孕。
女性怀孕后如果出现阴道大出血、剧烈的腹痛等情况，就需要到医院找专业的医生进行治疗，因为这两种症状是宫外孕的典型症状，宫外孕需要及时停止孕育，以免影响孕妇的生命。
怀孕了还看不见孕囊属于正常的生理性表现，并不是没有怀孕导致，可以继续观察并且定期复查。此外，还有可能是宫外孕引起的异常现象，必要时应及时到医院就诊，避免出现不良后果。
一些宫外孕的女性，可能会因为宫腔外的环境不佳、胚胎生长发育不佳，导致检查彩超可能看不到宫腔内有孕囊的出现，但是在宫腔外却可能会有异常的包块长出，甚至宫腔外还可能会看到孕囊的出现。此时，可能需要考虑尽早进行腹腔镜微创手术终止妊娠，以防止包块破裂导致大出血的情况发生，而危及生命。
如果怀孕时间很短，在5周内看不到孕囊是由于时间短，长时间看不到可能宫外孕或胚胎发育慢，具体需要观察一星期复查。注意观察有无腹痛及阴道流血与肛门坠胀等宫外孕破裂征象。B超检查还不明显，但也不能排除宫外孕可能。
胎儿进行超声检查时，未见胆囊，有可能和胎儿的体位有关系。部分组织、器官被遮挡，是常见现象。孕妇可以下床适当活动以改变胎儿体位，再去复查，或者是过一段时间后，定期复查看看。
怀孕40天B超孕囊看不到，一种情况是由于胚胎生长发育障碍，没有形成正常的孕囊。
也有很多女性是由于月经周期不规律，或者排卵推迟，受孕相应的比较晚。那根据末次月经来推算出的怀孕40天，实际上就难以反映真正的妊娠状态，可以在1周后再复查B超。一般情况下月经周期规律的女性在怀孕5周通过阴道超声可以看到孕囊，6周就可以观察到胎芽及心管搏动。