孕早期同房并不造成畸形，胎儿畸形多发生于宫内，多由本身遗传物质所致，占比高；也有因环境因素如物理，化学等不利因素所致；也有由多因素造成，即遗传因素与环境因素共同作用。
因此这些畸形的发生与孕期同房无关，但孕早期同房可能增加感染几率，甚至由于用力过猛、同方节奏加快而造成流产几率相对较高。如妇女妊娠早期出血和腹痛，则应严禁同房，否则会增加胚胎流产几率，造成不全流产和出血或完全流产不良后果。
通常阴道用药成分比较明确且一般在局部发挥作用，若是在遵医嘱的情况下塞了妇科的药物，不会导致胎儿畸形。
怀孕初期经过专业医生的指导，通过阴道上药，药物在局部发挥作用，通过血液循环进入胎盘或胚胎体内的，或者通过阴道的黏膜被孕妇吸收到体内的量都是很少的，可以忽略不计，不必过于担心。
建议孕妇避免过分焦虑、紧张、刺激，保持良好心态，适当加强营养，保证胎儿发育，注意饮食的卫生。定期去正规医院做孕期常规的产前筛查、产前诊断及超声检查，实时关注胎儿变化，就可以排除大部分胎儿畸形或异常的情况，不用太担心。
在怀孕初期，切忌同房。
由于此时同房易导致流产发生，因此，有必要加以规避。妊娠中期的孕妇应该尽量不要进行拔牙手术，因为此时胎儿已经开始发育，身体机能还不够健全，对于外界刺激很敏感。通常情况下，妊娠前后三个月内忌同房，怀孕初期同房，可激发导致流产，后期可造成早期破水，感染情况对胎儿造成严重不良影响，因此，妊娠前、中、后三个月都忌同房，其他时间可同房，但要注意插深，以免传染，这也未尝不可。
刚怀孕初期最好不要同房。
通常情况下，孕妈在孕早期进行同房可能会导致流产，以及可能引起病原菌逆行性感染，引起宫腔内的炎症，危及胎儿的安全。所以孕妈在前3个月和后3个月期间是禁止同房的，在孕中期可以适当进行同房，不过同房时幅度不要过大以及次数不要过多。
建议孕妈在孕期多注意休息，同时养成良好的生活习惯。
怀孕初期是否可以同房，需要根据怀孕的时间来进行判断。
通常建议，在怀孕初期1,2,3个月，应该避免同房。因为这时女性体内雌激素水平较低，对妊娠不利。因胚胎正在发育，尤其胎盘与母体子宫壁之间联系尚不紧，若发生性交，极有可能是行动不当，或者是在心理上过于激动而不小心，引起子宫的振动，极易引起胎盘脱落而导致流产。所以在孕期要尽量保持安静，尽量避免与外界接触。孕中4、5、6月可同房，但要讲究体位，不要挤压女方的腹部为宜，要适度，变换性交方法。因为此时双方都要保持一定的活动量，这样可防止阴道感染，同时能促进胎儿生长发育。行动不能过于粗野，不然还会造成流产可能，怀孕晚期7,8,9个月时，不要同房，否则会引起早产。
孕妇怀孕初期不能同房：
孕初期同房，有可能会引起产妇产道的感染，从而导致胎儿的畸形。受精后三周一直到怀孕三个月，这个时期是胎儿的各种细胞高度分化，也就是各个脏器形成的时期，这是非常重要的时期。各种刺激都有可能会导致畸形，包括感染的出现。孕初期同房，性生活产生高潮以后，孕妇本身会引起阴道和子宫的收缩，子宫收缩也有可能会引起流产。如果动作过于粗暴，本身的机械刺激也有可能引起流产。