如果胎儿脑积水较轻，小于1CM,部分可自然消退吸收。如不完全退行，则可在胎儿出生后经处理及分流手术根除。
如脑积水较重，在一般情况下，对于胎儿智力及发育都有一定影响，因此，提示应及早预防及确诊胎儿。建议孕妈妈多吃一些含蛋白质食物，补充蛋白粉、以及各种营养成分如复合微量元素，提前防止宝宝脑积水。主张孕妇要做好自我防护工作，经常进行胎儿排畸筛查工作，预防弓形虫病毒感染，避免婴儿脑积水。
胎儿脑积水的治疗方法，主要是根据胎儿积水量进行判断。
侧脑室的宽度在10mm以下，一般不需要进行手术，只要定时检查即可，否则会自动消失。侧脑室的宽度大于10mm，但不大于15mm，要进行DNA检测，也可以进行羊膜穿刺。
如果有大量的积水者，比如出现了侧脑室扩大的情况，就需要进行侧脑室的腹腔分流。如有颅内硬膜下积液，建议行硬膜下腹腔分流术。
胎儿磁共振可以判断胎儿脑积水。
孕期胎儿侧脑室宽度正常者不大于1厘米，如超出需考虑的脑积水范围，不越则不必忧。新生儿颅内出血时也可以出现脑积水，但是由于临床上对本病认识不足，容易误诊误治，造成不良后果。而经磁共振检查也相当精确，可以判断胎儿脑积水。脑积水积聚存在于脑室系统中，脑积液堆积过多，可能会导致脑室压力升高，如果出现这种情况，应该合理治疗。
胎儿脑积水通常可以自己吸收。
一些胚胎的脑部结构比中脑导水管的发展要快。脑脊液生成之后，由于没有足够的血液进入到导管，导致大脑的小面积膨胀。由于脑部的发展，轻微的膨胀可以被孩子们完全的消化，然后再回到原来的状态。大多数的胎儿都有先天的异常，例如四脑室时孔的关闭、中心孔洞的关闭、某些先天囊肿等。生还的几率很小。
是不需要治疗的，胎脑的发育有时会比脑中导水管系统快，脑内产生的脑脊液量明显大于导水管系统的循环能力时，会轻微脑积水，这种轻微脑积水会随着脑内导水管系统的发育完善而逐渐消失。
