治疗输精管堵塞的方法是切除精索、精囊、前列腺肿瘤或囊肿，或者周围其他器官肿瘤、囊肿产生压迫者，可行手术切除。输精管附睾吻合术病变在附睾尾部，可行输精管附睾吻合术。输精管吻合术如果梗阻在输精管，可行梗阻段切除，输精管端吻合术。
目前对于输精管阻塞的治疗主要是对因治疗的，也就是说先要找出输精管阻塞的病因，找出病因后先治疗病因，病因治好了以后输精管自然就会通畅了。临床上对于输精管堵塞的治疗最为常见的方法还是手术治疗，其中，输精管吻合术就是一种能有效治疗输精管堵塞且难度较低手术，具有对输精管堵塞的损伤小、治疗时间不长等的优点。
要根据病的程度来判断治疗的时间。输精管堵塞不是一个独立的病，而是多种病造成的一种症状。进行正确的治疗，坚持治疗，减少吃那些辛辣，刺激的食物。多吃一些清淡的。
输精管堵塞不是一个独立的疾病，而是多种疾病造成的一种症状。治疗时首先应针对原发病治疗，抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，也可以采用中医疗法，用中药来调节。
输精管堵塞不是一个独立的疾病，而是多种疾病造成的一种症状。治疗时首先应针对原发病治疗，如抗炎、抗痨、抗肿瘤等，亦可将堵塞处切除后进行断端吻合，个别情况下可直接从附睾处吸取精子进行人工受精。中医认为输精管堵塞是由于瘀血阻塞精道所致。从而使肾精下泄受阻，无法泄精受孕，并将其分为寒滞血瘀和湿热瘀阻两型。服用药物，全面提升精子质量、提高怀孕的成功率。还有戒烟酒，忌食辛辣刺激性食物，达到饮食营养均衡。
治该病可以去正规的三甲医院治疗。在对这种输精管堵塞的疾病治疗的时候，要注意查明导致该病的原因，譬如附睾出现了炎症或者是前列腺发生了炎症，或者是精囊出现了炎症等，都会导致输精管堵塞。从而进行针对性的治疗。