肾小管损伤很容易导致出现一些肾功能下降，或者是导致肾萎缩的现象。要到专业的肾内科来检查肾脏功能和肾脏的CT来做出一个明确的判断，要选择药物干预或透析治疗的方式，这种病一般并没有自愈性。
如果是由急性因素导致的肾小管损伤，只需要补充足够的热量、维持水和电解质平衡等待一段时间以后，肾小管受损就自行恢复。如果是由慢性因素导致的肾小管损伤，也没有特效的药物，只能是避免导致肾小管损伤的这些因素，防止进一步加重。
肾小管受损以后，主要影响的是浓缩功能。尿常规里表现比较明显的就是尿比重降低，尿比重低于1.005，尿中可能出现尿糖，而且没有糖尿病。而尿蛋白，尿白细胞和尿隐血表现不是很明显。
用于判断肾小管功能的是查肾脏彩超，肾脏穿刺，24小时尿蛋白定量，尿轻链，抽血查体内的电解质和碳酸氢根浓度，肾功能，肾小球的滤过率。通过检查，可以初步明确是否有肾小管的病变，以便对症治疗。
肾小管疾病是否可自愈需根据疾病致病原因分析，若为药物引起的急性肾小管损伤，部分可自愈，因为肾小管上皮细胞具有再生功能，一般恢复期约为14天，肾小管上皮细胞再生，形成新的上皮细胞，可恢复其基本生理功能。
肾小管损伤首先需要去除病因，如药物或其他原因所致，可以恢复的。如果感染不能控制住，考虑细菌耐药，需要换用抗生素，以防止引起败血症出现全身症状。另外有些抗生素是有肾毒性的，长期服用会引起肾功能损害。