对于青春期前的，如果有阴茎短小，要看一下是否有内分泌疾病所致，比如脑垂体疾病，导致睾酮分泌减少，如果及时补充睾酮，可以在青春期有正常的发育。另外是否有先天性的畸形，比如尿道上裂或者尿道下裂的。
阴茎已经发育成熟了，不能再次发育了，阴茎增大器没什么用，如果不满意，只能采用阴茎延长术治疗。男性阴茎的长度、直径以及勃起后的角度等个体差异较大，目前除了手术延长之外，尚无其他有效的方法延长。
物理方面治疗男性阴茎短小的问题是不科学的，男性的阴茎在18岁之后就已经发育完全，是不会在二次发育的，物理治疗的方式也是达不到治疗的效果，唯一一种办法是通过手术治疗，通过延长手术可以使阴茎延长3-5公分左右，其他方法都不可以采用。
如果有正常的功能的情况下，做手术时是较为慎重的，考虑用悬韧带手术，切断悬韧带，使其增长；还有一种就是增粗，通过使用一些人工材料，包绕在阴茎的外侧即皮下使其增粗，最常见的材料就是高泰克斯或者膨体，都可以制成特殊形态，包绕在阴茎外面，使其在视觉上达到增粗的效果。
阴茎增大膏一般没有效果，尽量不要盲目的尝试。如果男性在发生性关系的时候，性满意度比较高，一般不需要做生殖器部位的手术。但若男性的阴茎特别小，可能会影响到正常的性生活，可以考虑通过做阴茎增粗手术的方式。但是手术有一定的风险性，如果操作不当，可能会造成性神经受损。
主要是因为有阴茎短小的一般，如果阴茎短小是天生的问题，不可以治的，这个手术都是没有很大的作用。应该注意下，如果是阴茎短小做手术，这个都是问题不大的。但是效果也是没有很大的改变。