阴茎内包皮里长了个针孔大的小水泡。如果没有什么症状，也就这么一个继续观察一下，保持阴部清洁，每天用清水清洗一次，清洗时要翻开包皮清洗龟头冠状沟，如果有痒痛症状又有不洁的性生活，是不能排除感染疱疹病毒的。淋球菌感染通常会有脓性分泌物，支原体检测包括人型和解脲原体，这是一组的都需要检测。
包皮长水泡，伴随疼痛，有可能是细菌感染导致的炎症，或者是病毒感染引起的疱疹，可以去医院做一些相关的检查，明确病因之后，及时对症治疗。平时要注意不要有不洁的性行为。
应该是生殖器疱疹。生殖器疱疹即发生于生殖器部位的单纯疱疹，是病毒性传染性皮肤疾病，中医属于热疮的范畴。与发生于口角处的单纯疱疹不同，绝大多数通过性关系传染。据有关报道，国外性活跃的青年患生殖器疱疹的很多，发病率甚至高于梅毒、淋病。
包皮过长、手淫，创伤性感染等，导致剥离角质化上皮和腺体分泌，对其他细菌形成一个良好的生育条件，引起炎症，其临床表现是更常见的在当地的瘙痒，红肿，侵蚀，溃疡，严重的发烧、发冷、，甚至可以看到阴茎的肿大和疼痛。定期清洁包皮和阴茎头，保持包皮腔干净干燥。包皮过长或包茎应行包皮环切术。应避免清淡饮食，避免辛辣食物。
一般情况下，包皮起水泡可以通过药物治疗、生活护理等方式进行改善，具体内容如下：
包皮起水泡有可能是生殖器疱疹。如果要确诊，最好是到医院进行简单疱疹病毒检测和面诊。如果是生殖器疱疹，应该要及时的进行治疗，患者可以先口服更昔洛韦，再在外用干扰素软膏。同时，在治疗过程中也要注意饮食方面的问题，还要避免同房。