女性导尿术的消毒顺序为初次消毒顺序：从阴阜开始-对侧大腿上1/3-近侧大腿上1/3-对侧大阴唇-近侧大阴唇-对侧小阴唇-近侧小阴唇-阴道口-尿道口-肛门周围-肛门。二次消毒：尿道口-阴道口-对侧小阴唇-近侧小阴唇-对侧大阴唇-近侧大阴唇-阴阜-对侧大腿上1/3-近侧大腿上1/3-肛门周围-肛门。总之，会阴部位的消毒，初次消毒是从外向内，肛门最后，再次消毒是从内向外，肛门最后。
男性导尿操作，是需要顺序的，而且需要严格消毒，顺序是先消毒尿道口，阴茎，再把范围扩大到阴囊和会阴部，反反复复消毒三次，后再插尿管，注意尿管的深度，一般都是插到底。插入尿管动作要轻柔，以免损伤尿道黏膜，若插入时有阻挡感，可更换方向。
首先打一盆温水，将会阴部做基本的清洗，应该从大腿的根部向会阴部，以及阴道尿道口进行消毒，反复消毒三次，然后再由尿道外口，以及会阴部向外进行消毒，这才是正确的消毒方式。
男性导尿术的目的是引流尿液，属于侵入性治疗措施，严格规范的消毒，避免因操作不当引起的交叉感染或细菌定植。男性导尿术消毒，一般选择碘伏溶液消毒，首先以阴茎根部为中心（包括阴茎体），自内至外消毒，范围超过距离阴茎根部15到20厘米，消毒两遍。之后铺无菌单，左手拿无菌纱布夹持阴茎体，右手用镊子夹持碘伏棉球，消毒阴茎头、尿道外口，如果有包皮过长者，需要翻转包皮，彻底消毒，祛除包皮垢。
男性导尿首先要选择合适型号的尿管，要做好局部消毒，会阴区消毒，然后要充分润滑导尿管。左手提起阴茎，将阴茎竖直，可以使尿道的耻骨前弯消失，有利于尿管置入。置入尿管时动作要轻柔，尽量减少痛苦。
会阴消毒的顺序先消大小阴唇以及会阴前庭大腿内侧，最后进行肛门的消毒，反复要消毒两次就可以了，如果一旦颠倒，可能就会把肛门内的大肠杆菌带入到阴道口，而造成局部的炎症性反应。
