一般是由于化脓性细菌感染引起的。临床上最常见的是淋病双球菌，人体的尿道粘膜是淋病双球菌十分好的宿主，感染人体以后，在尿道粘膜生长繁殖引起局部炎症反应，所以会出现症状。
有可能是前列腺炎，前列腺炎会出现小便时有不适感，出现小腹部疼痛，如果确定是前列腺炎可以服用药物治疗，每天用温水坐浴，注意卫生，穿纯棉线的内衣每天更换，洗后暴晒，不要穿紧身的内衣和裤子，不要长时间坐着。
男性出现生殖器疼痛可能这两种原因。
1、是海绵体病变，如海绵体萎缩、海绵体硬化引起的，需要通过阴茎血流多普勒的检查明确诊断，然后口服红景天胶囊、血栓通片、泼尼松片持续的治疗四到八周以上症状才能够得到有效的缓解。
2、生殖器炎症，如睾丸炎、附睾炎、阴囊炎。炎症的刺激使睾丸出现疼痛，且睾丸炎可使睾丸功能受损，生精能力下降，如治疗不及时，可造成男性不育。
腰疼带着腿疼是典型的腰椎间盘突出症的表现。椎间盘突出会压迫到神经根，引起神经根支配范围的放射性疼痛及针刺样的疼痛，椎间盘突出也会引起腰椎椎管内的压力产生变化，通过窦椎神经会反射到腰部，引起腰部的疼痛。还需要排除有没有胸腹部的主动脉瘤、主动脉夹层以及其他的血管性疾病的存在，这些致命性的疾病也会引起腰疼带着腿疼。
小便腰疼可能是急性肾盂肾炎、急性前列腺炎等原因引起的。
急性肾盂肾炎主要是因为泌尿系统的细菌逆行感染引起的，主要表现为腰部疼痛、发热、恶心、呕吐等症状，需要去医院进行尿检，通过肾彩超来确诊。男性患上前列腺炎，一般与经常同房，经常自慰，不注重私处的清洁等因素有关，也需要去医院检查，以确定是否有可能是因为前列腺炎导致的小便腰疼。
