包皮包茎的危害有，感染：尿中之沉积物与尿垢积于包皮内，成为细菌培养剂，或因刺激而致感染发炎、并导致包皮粘连，严重时还会造成不育。阻碍发育，结石等，有包皮过长或包茎的人应当作包皮环切手术。
和包皮过长造成早泄的原因相反，不射精往往是包茎造成的。由于龟头受到了皮肤的过分保护，龟头丰富的神经传导性刺激、激发性兴奋的功能消失，在性生活中达不到激发射精所需的刺激强度，就容易出现不射精了。
包皮过长和包茎临床上的危害是比较多的。龟头周围要产生分泌物长期堆积在里面不出来叫包皮垢，长期持续下去最大的危害就是容易导致阴茎癌。卫生方面不行容易形成龟头发炎或者包皮发炎在平时临床上可以导致一些炎症，比如龟头炎，包皮炎临床上还在性生活的时候导致出现性生活质量下降，阳痿早泄临床上如果有炎症或者包皮垢的时候在性生活当中，而且还会导致女方的阴道出现阴道炎或者霉菌性阴道炎，细菌阴道炎等疾病。
首先是引起嵌顿包茎，严重的会使龟头坏死。特别是包皮茎口很小的男性，往往上翻不动，只能紧紧嵌顿于冠状沟，就会发生嵌顿包茎的情况。还会引起阴茎发炎的症状。妨碍阴茎发育，和影响性生活质量，包茎会影响阴茎的发育。
男士包皮过长最大的危害，就是反复发生包皮龟头炎，也有可能导致阴茎癌。已婚的男性包皮过长，可能会导致早泄，也可能因为性交，导致女性出现阴道炎。长期包皮过长不注意卫生进行性交，可能导致女性宫颈癌的发病率增加。
临床上主要会导致一些包皮或者包皮龟头炎，而且还会导致射精过早等射精功能障碍，而且严重的还会导致阴茎癌。所以如果出现包皮或是包茎，必要时还是需要及时去医院进行割包皮手术。