肾结石软镜手术通常会有一定的疼痛感。
肾结石是体内晶体物质析出后沉积于肾脏内所致的现象，可能使患者有剧烈腰痛的症状。在治疗时，可以采取肾结石软镜手术。在进行该项手术时，通常有疼痛症状。因为肾结石软镜手术就是把一根柔软的管子从尿道、膀胱里穿过去，然后塞进输尿管里，如果在没有麻醉的情况下进行，通常会产生疼痛感。所以，在做这个手术的时候，可以用麻药来减轻疼痛。如果肾结石的体积比较小，还可以通过药物进行排石，暂时无需手术。
通常情况下，肾结石软镜手术过程中是不会有任何痛苦的，术后可能会出现疼痛。
因为做输尿管软镜的病人，都是在麻醉下做的，并且是全身麻痹，不会有任何的痛苦。当然，经尿路和输卵管软镜的操作，就是从身体内部的天然空腔，经过尿路，再经过输尿管，再到肾，再用激光等碎石器械将其击碎，这样造成的伤害会更少，而且术后患者的痛楚也会少一些，因此，做软镜的患者并不会太过于紧张，因为一般都是很轻的。
肾结石软镜手术通常伤肾，建议患者注意术后护理，具体分析如下：
肾结石软镜手术对肾脏有一定的损害。软镜手术是利用输尿管软镜，经尿道、输尿管、膀胱逆行插入肾盂内，粉碎、取出结石，手术过程中需要不断冲洗水，因此，即使是微创手术，也会对肾脏造成肾周液体渗出、水肿。其中结石中的细菌会随着压力的增加而进入肾脏，从而导致脓毒血症。在碎石时还可能会损伤肾盂及肾盏黏膜，造成一定程度的损伤及出血。
肾结石软镜的手术过程有几个必要的步骤，首先就是要打麻药，缓解手术中病人的疼痛。其次进入手术室后会有护士帮助吸痰，另外在清洗膀胱之后才可以真正开始手术。之后给手术部位消毒，抽取一些血液样本。最后主治医生会将一根导管插入体内，利用一条细软管镜，经过尿道、膀胱插入输尿管，将输尿管结石或肾脏结石击碎取出，后拿出导管，手术就完成了。
软镜手术首先要麻醉，麻醉后消毒、铺巾。留置膀胱内尿管，在直视下将输尿管硬镜插入膀胱，然后插入输尿管，在输尿管内放置斑马导丝，然后退出输尿管镜，再通过输尿管内放置的斑马导丝，放入输尿管内的送达鞘，通过钬激光将结石击碎，然后将结石冲洗出来，拔出输尿管软镜，在导丝的引导下放置双J管，拔除输尿管送达鞘和尿管，手术则结束。
肾结石软镜手术后一个月左右可以剧烈运动，具体分析如下：
肾结石经输尿管软镜碎石术后，大约一个月左右即可进行剧烈的运动。输尿管软镜碎石术后，通常会在输尿管中放置一个支架，在拔出输尿管支架前不要做太大的运动，但是日常的生活还是可以的。需要在一个月左右取出输尿管内支架，然后再进行剧烈的运动，不然会出现血尿。