肾结石做手术对身体的伤害不是很大，手术治疗是有创性操作，只要是有创性的操作，对身体都会有伤害。手术过程中还需要麻醉，麻醉对身体也是有伤害的，因此，肾结石手术对身体是有伤害的。
肾结石碎石的过程中，对肾脏有一定的伤害，但是伤害都比较小，一般问题不大，碎石几乎都会出现肉眼的血尿，血量的多少与碎石所用的能量成正比，还与人局部毛细血管的脆性有关，都是2-3次血尿，严重的2-3天之后血尿也会自行消失。
伤害不大的，但是如果不去做这个治疗，然后这个时候可以进一步增大，然后导致肾积水，然后肾功能下降，血肌酐升高，导致一侧肾脏萎缩的。非手术治疗一般采用中成药物的治疗。手术治疗有体外冲击波碎石、微创手术。多食菠菜、苋菜、空心菜、芥菜等。
肾结石如果大于零点五需要采用手术。手术分为四种方式：体外冲击波碎石、输尿管肾镜取石、经皮肾镜取石以及开放手术。选择何种手术方式，与患者结石大小以及部位有关系。
肾结石0.3厘米不算严重，但人们要及时的去进行治疗好。早期去治疗肾结石，结石一旦超过一厘米，就要进行手术治疗。病情越严重，所采取的治疗方法风险性就会越高，对人们身体带来的影响性也会越大。为了减轻这种疾病的干扰，生活中人们也要进行适当的预防，多喝水，多去进行体育锻炼，注意好人们的饮食习惯。肾脏是很重要的一个部位，需要大家多去进行呵护，给它一个更好的安全环境。
如果肾结石较大超过2个cm，此时就需要通过手术的方法进行治疗。另外，如果是多发的肾结石，也需要通过手术的方法进行治疗，如果结石在2cm以内，但是由于存在尿路梗阻，比如存在输尿管狭窄等一系列疾病，此时也需要通过手术的方法来进行治疗。