肾结石引起的疼痛是在腰部，在脊柱2侧，12肋骨下的位置，也就是肾脏在体表投影的区域，也称为肾区。如果是比较大的结石引起的疼痛，位置一般都局限在肾脏位置。但是如果结石比较小，落入输尿管后会引起肾绞痛，疼痛会牵扯至上腹部以及下腹部，绞痛出现时还会伴有恶心，呕吐的消化道症状，部分还会有血尿出现。
女性肾结石首先腰腹部还有肾区的疼痛，严重，还有向下腹部以及会阴部放射，可出现尿频、尿急、尿痛等下尿路刺激征状，肾结石病人还会出现血尿、高热、寒战、可伴有恶心呕吐的现象，肾结石引起的疼痛往往呈绞痛性质，疼痛剧烈难以耐受。
一般来说，肾结石会造成疼痛，是由于结石堵塞造成的，患者会有腰部的疼痛。
腰绞痛和腰胀痛都有可能是比较强烈的，要看结石的严重程度和阻塞的时间。如果是急性结石，会导致腰酸背痛。此外，还会出现恶心、呕吐、尿道刺激等情况。当然，如果结石堵塞的时间长了，就会导致肾脏积水，此时腰疼也会出现，不过疼痛一般都是比较轻微的，以腰部的胀痛为主，或者是酸胀痛。
肾结石疼痛部位主要根据结石的部位，如肾结石，主要表现在腰背部疼痛为主，具体位于腰椎及肋骨的交叉处，疼痛比较剧烈，会有恶心、呕吐，部分病人有腰背部胀痛的感觉。定期进行检查。
右肾结石引起的疼痛主要在患者的脊肋角、腰部、上腹部，大多数都是阵发性的疼痛，当然也有部分是持续性的疼痛。一般疼痛主要表现为腰部酸胀不适、隐痛等，在活动或劳动以后会促使疼痛发作或者加剧疼痛的症状。
肾结石会刺激输尿管引起痉挛。疼痛常突然发作，始于背、腰或肋腹部，沿输尿管向下腹部、大腿内侧、外阴部放射，伴有排尿困难、恶心呕吐、大汗淋漓，结石通过尿道时有尿流堵塞在尿道内出现刺痛感。