肾结石手术有两种。输尿管软镜，输尿管较长，肾脏结构分为很多小的腔隙，软镜可以进入肾脏各个腔隙，将结石打碎，用抓钳、取石网将其取出。或者通过激光将结石粉末化，通过尿液作用和重力作用排出体外。经皮肾镜，适用于较复杂或者结石体积较大的患者，在超声或X线定位下，于人体腰部肾脏部位建立通道，伸入肾镜，在显示器下使用激光、弹道或超声将结石粉碎，并直接冲出体外。
肾结石手术主要有经皮肾镜取石术和开放性手术两种。经皮肾镜取石术创伤比较小，但是，视野有限，操作起来难度比较大。而开放性手术视野比较宽，但是，它的缺点是创伤比较大。
通常肾结石的手术仍属大手术，尽管创伤相对较少，但操作仍有一定困难，因此，对肾结石手术通常属大手术范畴。
对手术进行分级，通常可划分为4个等级，一级手术与二级手术通常都是小手术，而且肾结石的手术通常属于三级或四级手术的范畴，因此，肾结石的手术通常属大手术。在手术过程中如果患者出现了严重的并发症，就会对其造成非常大的影响，因此必须要采取一些措施来保证手术的顺利进行。肾结石的手术虽属微创手术范畴，有的甚至可无手术切口，或手术切口相对狭小，主要仍须视手术难易程度和手术等级来决定手术类型。
如果做了肾结石手术，可以食用罐头。
罐头是一种非常好的补充身体所需要能量的食物，所以人们可以吃一些罐头，不会引起石头的发生率，对肾脏也没有任何的帮助。建议患者在手术后多饮水，多饮水能促进尿量的增加，降低尿液的密度，降低结石的沉淀，有助于清除结石，防止再次出现。另外还需要在日常生活中多吃一些食物，比如有草酸盐结石的人要少吃菠菜、花生等。建议人们多饮水，少吃火锅、动物内脏等。建议服用一些可以防止尿酸结石的人服用别嘌呤醇来防止结石的发生。
对于肾结石术后进食，应视术后特定时间而定，如为肾结石手术患者，多需麻醉，包括半身或全身麻醉。所以，在麻醉下的手术过程中，如果不能够很好地控制患者的食欲，会导致病人出现呕吐的现象。
通常麻醉手术那天不可以进食，只等胃肠道的功能逐渐恢复后，才能吃东西，如等患者有排气后再吃，即可食用少量流食，例如温开水和稀饭。
再随患者胃肠道渐趋正常后，还能逐步恢复正常饮食。在对肾脏手术后的患者实施护理时，建议进食易消化食品，例如有些面食，面条，馒头等。这些食物更易于消化，手术后患者康复情况亦较理想。