引起龟头上长水泡的原因可能是龟头炎和生殖器疱疹，两种病都有类似的症状。不过龟头炎容易治疗，治疗后平时对注意局部卫生，生殖器疱疹是一种性传播疾病，极难治好，容易复发。
龟头上有小水泡，主要是因为疱疹、包皮龟头炎等引起的。
1.疱疹：通常是由病毒感染所致，多见于神经系统，以水疱为主要症状，多见于皮肤黏膜，临床上可应用阿昔洛韦、伐昔洛韦、加巴喷丁等药物治疗。
2.包皮龟头炎：包皮龟头炎主要表现为阴茎包皮、阴茎头充血、红肿、糜烂、溃疡、小水泡等，严重时可出现尿道炎、尿道口狭窄、包茎等并发症，可以使用伊曲康唑、甲硝唑、氢化可的松等药物治疗。
龟头长小水泡，可能是由于患者出现了包皮龟头炎导致的，由于长时间的炎症刺激,可能会导致患者出现了,龟头有水泡的产生,对男性的健康是不利的。
龟头上长了小水泡的诱因较多,包皮包茎或者是长期手淫可能会导致患者出现的局部有水泡的产生,导致出现了水疱部位疼痛和水泡破裂的症状。此外，也可能是由于出现了疱疹病毒感染导致的,可能会导致出现群集小水疱,疱壁非常的薄,很容易会导致局部结痂,或者是出现了溃烂的现象。
男性平时多注意身体方面的护理,如果出现了龟头上长水泡的现象,根据患者的病因进行合理的治疗,建议到正规医院,通过使用检查的方法进行疾病的判断。
龟头上长了水泡主要是生殖器疱疹导致的。
生殖器疱疹一般是由单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器及肛门周围皮肤黏膜而引起，好发于包皮、龟头、冠状沟等部位，患者感染上单纯疱疹病毒后，龟头上常会出现水泡、烧灼感等情况。患者可以使用炉甘石洗剂、盐酸伐昔洛韦片等药物，应避免不洁性交，注意休息。
一般来说，龟头上有一个小的水泡，需要考虑是不是局部的炎症引起的。如果局部有水泡，一定要避免用手挤压，否则会引起局部的炎症蔓延，从而加重病情。可以用温水和高锰酸钾水进行外洗。可以在局部使用百多邦或红霉素软膏，在治疗过程中要避免食用辛辣、刺激性的食物。如果出现反复的情况，需要到医院泌尿外科进行诊断。如果需要，可以根据需要调整药物来进行治疗。
一般情况下，龟头上起小水泡可能是疱疹病毒感染、神经性的疼痛、性接触等原因引起的。具体内容如下：
1.疱疹病毒感染：如果是因为疱疹病毒感染，所以会出现龟头上的小水泡。疱疹病毒主要是通过生殖器官传播，在生殖器官上会出现很多小水泡，并且会合并形成一个大的水泡。
2.神经性的疼痛：如果有水泡的部位会有比较明显的瘙痒感，就好像是有蚂蚁在上面爬行，还有可能是神经性的疼痛。
3.性接触：大多数人都是通过性接触来传染的，如果是在同房的时候，接触到了潜伏期疱疹病毒，或者是接触了疱疹的患者，就会被传染。