可以通过心理治疗、药物治疗等方式治精神性功能障碍。
性功能障碍，临床较多，对精神性性功能障碍者来说，或采用主动心理咨询，心理疏导等方式治疗，也许能收到一些成效。同时，心理治疗时，也可酌情辅助性地应用某些药物进行治疗，如采用抗焦虑，抗抑郁用药处理，可能对于性功能障碍症状有一定改善，还能有所裨益。另外还有一种情况就是由于夫妻双方都存在不同程度的心理障碍，或者是一方出现了心理疾病，而导致性功能障碍，此时就需要通过咨询医生的方式，了解自己的问题和原因。当然，还有一些病人，可能是夫妻关系紧张导致关系恶劣，因而导致性功能障碍，因此应该主动交流才能使性功能障碍表现出来，获得逐步缓解。
精神性功能是一个复杂的生理过程。正常性功能的维持依赖人体多系统的协作，涉及到神经系统、心血管系统、内分泌系统和生殖系统的协调一致，除此之外，还须具有良好的精神状态和健康的心理。当系统或精神心理方面发生异常变化时，将会影响正常性生活地进行，影响性生活的质量，表现出性功能障碍。
精神性功能障碍要接纳和适应性功能问题，减少不然的羞耻心，提高病人的自尊心和治疗的自信心，放松心情，减少压力，争取伴侣的理解和支持，促进伴侣之间情感上的交流，甚至在性技巧上给予一定的指导。
如果有什么问题，可以通过药物来解决，比如缓解患者的性功能失调，以及对原因进行治疗。
还有，就是治疗这种性机能失调的原因，比如患者发现荷尔蒙有问题。要注意调整体内的荷尔蒙，如果出现了血糖和血脂方面的问题，一定要注意控制。总之，这种性机能失调的疗法，除了对这种疾病的疗法之外，还包含了导致性欲失调的原因，其中还包含了对原因的控制。
性功能障碍应加强对性知识的引导，消除对性问题的忧虑和恐惧，纠正错误的性观念和性交方法，使夫妻的性生活协调一致。心理治疗强调个体化治疗，常用的有心理分析、厌恶疗法、全身脱敏疗法、家庭疗法等。主要通过性集中训练，使之逐渐适应，熟悉性交过程，提高自己的性反应意识，充分享受性交的快感，减少对性交的焦虑和恐惧。在治疗过程中，另一方应避免性体验、性自尊和性幻想的不良刺激，避免有害的性吸引活动。耻骨尾骨肌训练对于骨盆底肌松弛或产后耻骨尾骨肌发育不全的妇女尤其有效。