排卵障碍晚期可以选择药物治疗，药物治疗是一线治疗方法。青春期和育龄期病人以止血、调整周期、促排卵为主进行治疗。绝经过渡期病人以止血、调整周期、减少经量、防止子宫内膜病变为治疗原则。
不同的原因治疗方法不同，对于不排卵的时候必须去医院做电化学发光激素六项检查和阴道B超明确诊断后再对症处理。排卵障碍是常见的内分泌疾病，在不孕症中发病率可达25%—30%。其临床表现多种多样，如月经失调、多毛、肥胖、不孕等。
排卵障碍运用促排卵药物治疗。选择诱导排卵的药物是治疗排卵障碍的主要方法，以补血养阴为主，同时补肾阴的药物中加入补肾阳药，促使卵泡发育成熟。中医主要是活血化瘀，填精补髓，气血双补疏肝健脾的方法，使其气血调合，冲任元盈，故而有子。
可以及时检查。明确查否有排卵有正常的排卵。一侧输卵管也会有机会怀孕的。正常的成熟卵泡的大小是18-25mm。低于或大于此标准，那都无法正常的排卵正常的情况下，卵泡每天是以0.2CM的生长速度生长。
如何治疗排卵障碍不孕、宫颈因素，宫颈狭窄、息肉、肿瘤、粘连等均可影响精子通过；宫颈糜烂，其炎性渗出物有杀精作用；宫颈粘液中存在抗精子抗体，不利于精子穿透宫颈管或完全使精子失去活动能力，尤其是反复人流时更容易造成这一严重合并症，把精子拒之于宫颈口之外。而淋球菌等所致宫颈炎则是通过性生活感染的，常导致宫颈管闭锁或狭窄。宫颈内口松弛症是引起习惯性晚期流产而致不育的常见原因之一。
卵泡期以补血养阴为主，同时补肾阴的药物中加入补肾阳药，促使卵泡发育成熟。排卵期应在养精血的基础上加入通络、行气、活血的药物，以促发排卵。黄体期阴阳并补，而以补肾阳为主。创造一个好的受孕环境，为孕卵着床准备条件。