一般情况下，卵巢囊肿是可能会复发的。
卵巢囊肿的手术分为囊肿剔除术和卵巢切除术，如果患者在手术时选择的是囊肿剔除术，手术后体内有残留的囊壁，手术未切除干净，且手术后不注意护理，就可能会复发。有的患者除了患有卵巢囊肿，还合并有肾囊肿、肝囊肿，也可能会复发，且复发率可能会比较高。建议患有卵巢囊肿的患者应及时在医生指导下进行治疗，以免影响身体健康。
卵巢囊肿后期不注意保养是会复发的，去正规医院做一下复查，按医生的指导进行治疗，平时要多注意卫生，勤换洗内裤，作息有规律，适量的运动，锻炼身体，提高身体的免疫力。
无论是良性还是恶性的卵巢囊肿，都有复发的可能性。卵巢囊肿常用的治疗方法就是手术治疗，手术后有复发的可能性，因为常用的手术方法是卵巢囊肿的单纯性的切除，而不是连同卵巢一同切除，只要有卵巢及诱发因素存在，就会有复发的可能性。
一般手术以后，囊肿都是可能会再次复发的，由于炎性囊肿通常可以考虑进行输液来消炎止痛治疗，消炎以后囊肿会消失，如果再次复发感染炎症，囊肿就会再次复发生长，而卵巢巧克力囊肿是因为子宫内膜异位导致，所以即便切除以后也有可能会导致内膜的再次异位而复发。
卵巢囊肿一般是内分泌失调引起的，属于良性病变，生长缓慢，如果小于三个厘米，考虑是生理性的，可以先观察，暂时不用药物治疗，可以等月经干净以后复查看是否消失，只要是没有明显增长就没事。平时养成良好的生活习惯，不要熬夜，适当锻炼，增强体质。
卵巢囊肿是有复发可能的，卵巢囊肿容易复发的常见原因：手术只能把可见的巧克力囊肿剥除，但不能保证将潜伏着的很小的巧克力囊肿全部清除。而由于手术本身具有破坏性，一定程度上又会刺激这部分残留的巧克力囊肿生长。