治疗时间就是一旦发现就要进行积极的治疗，而且需要一直监管到绝经期为止，因为可能会导致月经稀发或者闭经的情况。一旦出现闭经，子宫内膜在雌性激素的作用下就会持续的增生，这样很可能会导致内膜的病变，甚至发展成子宫内膜癌，所以要给予干预，定期的让子宫内膜脱落来月经，这样就不会引起子宫内膜过度刺激。
积极进行锻炼，减少高脂肪高糖食物的摄取，降低体重，这样可以促使雄激素水平下降，对恢复排卵有利，药物治疗有对抗雄激素的作用，促使卵巢排卵，使用的药物主要是口服避孕药，药物同时可以调整月经周期，经过激素所平检测正常即可，平时注意休息，注意增加营养的，注意不要熬夜。
治疗费用视情况而定。卵巢发育不良的女性在治疗的时候可以使用促排卵药的方法来帮助强制排卵，如果女性出现卵巢发育不全现象，很有可能会对卵子的产生造成一些影响，甚至还会导致女性出现不孕不育现象，对于卵泡发育不良者，一般可采用促排卵药物。
卵巢发育不全医治方法有：使用激素医治，可使用具有混合激素的替勃龙医治，也可使用生长激素医治，对生活造成了很大的不便，所以要尽快的去当地正规的三甲医院进行医治，平时要注意休息，养成良好的生活习惯。
卵巢发育不全可以使用雌激素、孕激素做替代疗法。单纯的生长激素治疗，雌激素加雄激素治疗、雌激素加孕激素加生长激素的治疗，与孕激素加生产激素治疗的疗效相近，目的是促使卵巢的正常功能，促使正常的排卵。另外还可以使用中医的辩证论法进行治疗较好。
卵巢发育不全系外整倍体中单体型染色体数量畸变。用雌激素刺激乳房和生殖器发育效果良好但需长期使用。过早应用雌激素促使骨骺早期愈合。一般先促进身高，骨骺愈合后再用雌激素使乳房和生殖器发育。