右侧卵巢囊肿如果不影响卵巢的正常功能，卵巢有排卵，在输卵管通畅的情况下，就能够正常怀孕。因为只要另一个卵巢功能尚未受到功能性影响，其排卵已经其他生殖系统仍然正常，那依然是可以怀孕的，但是由于另一个卵巢功能受阻，女性怀孕的几率也就降低了一半。
孕妇体内的雌激素和孕激素水平会改变，从而导致生理性的卵巢囊肿，在妊娠前没有，在妊娠后会出现，多半是生理性的卵巢囊肿。
正常情况下，只要不超过3cm，就不需要做特别的处理，因为右侧卵巢囊肿会自动消失，所以要定期做B超检查，以了解囊肿的发育；如果右侧囊肿大于5cm，那么卵巢囊肿有可能会对子宫造成挤压，从而影响到胎儿的生长。
囊肿有可能是怀孕引起的。怀孕期间卵巢囊肿不太好治疗的，现在囊肿不大，暂时可以不作处理的，注意定期复查就可以了，如果不继续长大，对怀孕的影响不大的，如果长的过大，就可能需要手术治疗了。
孕检发现，需要观察到孕12周，看囊肿大小有无变化。怀孕之后可以合并黄体囊肿，而黄体囊肿会随着妊娠周数的增大自行缩小甚至消失。孕12周可以根据囊肿的大小、性质、部位、孕妈及家属的意见来决定。对于直径大于8厘米的囊肿，在孕16-20周，采用手术治疗。
因为右侧卵巢囊肿如果不影响卵巢的正常功能，卵巢有排卵，在输卵管通畅的情况下，就能够怀孕，经常能看到单侧或双侧的卵巢囊肿病人怀孕，或在怀孕后进行彩超检查时才发现有卵巢囊肿。有的囊肿在孕期时可能会增大，需要定期检查。中等大小的重心偏于一侧的卵巢囊肿，如卵巢畸胎瘤，有可能在孕期发生蒂扭转出现急性腹痛，需要进行手术治疗。
如果怀孕一方面要看性质，另外要看大小决定是先怀孕还是先手术。一般卵巢的肿瘤大于5个公分，通过2、3次的复查，肿瘤都存在，而且好像有增大的趋势，还有特别是肿瘤是一个囊实性，或者还有一些肿瘤的标记物提示有什么异常的情况，建议这样的肿瘤应该先手术再怀孕。