一般来说，卵巢囊肿可以通过药物进行治疗，具体如下：
卵巢囊肿是卵巢内或其表面形成的囊状结构，一般不会对人体造成损害，大多数患者的可自行消失。卵巢囊肿可以通过药物进行治疗，一般可使用桂枝茯苓丸、金刚藤口服液等药物。
在治疗期间，要充分休息，保证作息规律，养成良好的生活习惯，注意保暖，避免受寒，可适当加强体育锻炼，增强体质。
卵巢囊肿平时在饮食上注意多吃富含维生素的新鲜蔬菜和水果，避免生冷辛辣刺激性的食物和雌激素类高的食物，如豆制品类的。可以进行按摩调理。一般选择在晚上入睡前进行摩腹。
可以进行按摩调理。一般选择在晚上入睡前进行摩腹。先排空小便，洗净双手，仰卧，双膝屈曲，全身放松，左手按在腹部上，掌心对着肚脐，右手叠放在左手上。先按顺时针方向，绕脐揉腹30次，再逆时针方向按揉腹部30次，按揉时，节奏要慢，用力适中，呼吸自然，持之以恒。
卵巢囊肿的消除应该视病情而定，小于五厘米又没有查到明显的肿瘤指证的病人，多为功能性囊肿，可以密切观察，2至3个月检查一次，视病情情况采用药物治疗，中药西药都有比较明显的疗效，肿囊肿直径大于五厘米，则多为卵巢肿瘤，对此应该采用手术治疗，卵巢囊肿的危害相对比较大，因此必须认真对待，积极治疗，可以到正规医院诊治。
卵巢囊肿根据大小、位置、性质不同，治疗方法不同。一般以手术治疗为主，要看是否恶性，囊肿的部位，体积，大小和生长速度。如畸胎瘤，B超、平片检查可发现牙齿、骨头等特殊结构，肿瘤超过3-4cm需要进行手术处理。其它囊肿、肿瘤并无此典型表现。