巧克力囊肿预防需要注意调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。要注意自身保暖，避免感寒着凉。月经期间，禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。尽量少做人工流产和刮宫，做好计划生育。女性月经期一定要禁止性生活。
平时要多进食一些水果蔬菜，不要吃辛辣还有过凉的食物，月经期间禁止一切剧烈体育运动及重体力劳动。月经期要做好自身的保健注意控制自己的情绪不要生闷气，这样才能有效的防止复发。
巧克力囊肿属于子宫内膜异位的一种，这种手术后是很容易复发的，术后可以预防性的注射药物。可以减少复发的机会。同时经期不要同床，如果月经量多，可以口服止血药物治疗，避免月经量过多导致经血逆流，增加子宫内膜异位症的几率。
卵巢巧克力囊肿手术后是会复发的，复发率也是比较高的。复发的原因主要是因为巧克力囊肿大多数造成囊肿与子宫内壁发生粘连，通过手术也很难将囊肿完全切除，在切除的时候多数会造成囊肿破裂，从而引起复发。
卵巢巧克力囊肿手术后吃什么好：巧克力囊肿的术后饮食规则应该掌握，家禽家畜、蛋乳、鱼鲜一般均可食用，气血虚少者用以益气养血效果较好。田螺、蛤蚌、蟹、鳖偏凉食，宜少食，过于肥腻的食物也要少吃，对于谷类、豆类、薯类作为主食，均可食用，无需避免，术后饮食适宜清淡，应富含足够的营养，多吃牛奶、菠菜、山药、白菜、油菜、香菇、瘦肉、鸡蛋、鲫鱼、苹果、鸭梨、大枣、花生、黑米等食物。
卵巢巧克力囊肿手术后有可能会复发，巧克力囊肿本身就是由于子宫内膜异位在卵巢，并且周期性的出血才形成囊肿，手术后具有活性的子宫内膜细胞很可能随着月经周期再出血，就会导致复发。
