可以选择保守性手术和半保守手术：前者切除病变组织，保留子宫卵巢，后者切除病变组织和子宫，保留卵巢，根据年龄和生育需求确定手术方式。也可以做将子宫和卵巢同时切除的手术。
子宫内膜异位症如果病情比较轻微，可以正常怀孕，但是如果是内膜异位症导致了盆腔粘连、输卵管畸形，就会影响怀孕。正常子宫内膜异位症，如果是单纯一侧卵巢或者是盆腔内比较局限的病变，不会影响怀孕。
子宫内膜异位会对女性的身体造成很大的影响，容易导致痛经、子宫增大等，到医院进行专业检查，采取相应的治疗措施，不要错过治疗时间；对于子宫内膜的治疗根据的病情、年龄有所不同，目前的治疗方法以手术治疗为主，可以采用显微外科手术进行治疗，切除异位病灶。
要想治疗子宫内膜异位症，可以考虑手术治疗，现在治疗子宫内膜异位症首先应选腔镜下诊治，以求尽量去除异位病灶，然后用药巩固治疗。根据腔镜手术范围的不同，保留生育功能手术适用于年轻、有生育要求的。手术范围为尽量切净或灼除内膜异位灶，但保留子宫及双侧、一侧或至少部分卵巢。
子宫内膜异位症的治疗要根据患者的年龄、病情的严重程度、是否有生育需求来决定，具体的治疗方法有：
1、保守治疗：可以采用假孕术或假绝经治疗，在子宫中用药来控制女性的经期，从而达到假孕或者绝经的目的。
2、外科：现在采用的是微创技术，即腹腔镜，对病变进行全面的综合、根治性和半根治性的治疗，提高患者生存期、生活质量、怀孕率。
通常情况下，患者可以通过使用药物、手术治疗等方式进行治疗子宫内膜异位症。具体情况分析如下：
使用药物：子宫内膜异位症患者可以口服避孕药、促性腺激素释放激素激动剂（GnRH-a）、雄激素类药物（丹那唑）、孕激素受体拮抗剂（米非司酮）等。
手术治疗：年轻且有生育要求的患者，应进行保留生育功能手术；已有子女且患者年龄较大，应进行保留卵巢功能手术。