巧克力囊肿需要大约半个月的时间来恢复怀孕前的身体，并且疾病会在怀孕后恢复正常。手术后准备的妊娠越早，妊娠的可能性就越高。经过一段时间后，疾病复发了。此外，这种疾病的复发率很高。随着时间的推移，怀孕的能力会逐渐下降，手术后是最容易的时期。
有巧克力囊肿并不意味着无法怀孕。巧克力囊肿又称卵巢子宫内膜异位症囊肿，是引起痛经以及不孕不育的常见因素。如果是比较小的巧克力囊肿，临床症状不典型时可以先尝试怀孕，是有几率成功怀孕的。但是如果巧克力囊肿比较大，或者引起明显的痛经症状时，建议应该先进行手术治疗，同时在术后使用药物才能够提高术后的受孕概率。
出现了巧克力囊肿，已经到医院做了腹腔镜手术治疗，时候建议在半年之后不可以怀孕的。目前做了巧克力囊肿的腹腔镜手术治疗，还需要使用一些抗生素药物进行抗感染治疗的，如果准备怀孕，可以到医院妇产科就是考虑需要做腹部彩超检测，而且还需要做卵巢功能检查的。
巧克力囊肿术后是能怀孕，所以不要担心，需要看一下平时的月经情况的，怀孕前需要全面体检看一下，注意看看经期的情况是否规律或者预防囊肿反复的情况，巧克力囊肿，属于子宫内膜异位症的一种临床表现。因为妊娠可使子宫内膜停止生长，所以巧克力囊肿术后应尽早妊娠可以提高受孕几率。
巧克力囊肿手术后怀孕属于正常的现象，是可以怀孕的。在时间段主要是注意抽血检查孕酮和HCG值，因为术后卵巢功能还没有完全的恢复，时候可能会出现孕酮偏低的现象，进而导致流产。所以应该定期复查孕酮和HCG值，注意卧床休息。而且巧克力囊肿术后容易出现复发，所以应该定期复查彩超。
巧克力囊肿，属于子宫内膜异位症的一种，通常手术后三个月后再开始备孕。术后要注意不可以随便服用药物，尤其是激素类的药物，可以多吃些高蛋白高营养的食物，增强体质。平时注意少吃生冷辛辣刺激性的食物，注意腹部保暖，避免身体受风着凉，不要过度劳累和熬夜。