可以采用药物治疗或手术治疗，减灭和去除病灶，缓解和消除疼痛，减少和避免复发。常用的药物治疗有，口服孕激素类药物的假孕疗法和假绝经疗法。手术治疗需要根据病人的年龄和有无生育要求来确定手术方式。
宫内膜异位症的治疗以西药为主，有生育要求，尽量在医生指导下尽快怀孕，对子宫内膜异位症有治疗作用。可以彩超监测卵泡的情况，尽量排卵期同房，同房后抬高臀部，以提高受孕的几率。
子宫内膜异位的发病原因很复杂，有多种学说。但仍以经血倒流、种植和体腔上皮化生学说为主导理论。并且与现在的剖腹产、人工流产、腹部手术、遗传因素以及经期激烈的体育运动或重体力劳动均有直接关系。人流在刮不干净的情况下，也可造成子宫内膜异位症。
应对孕期子宫内膜异位症需要根据自身情况进行处理。
在怀孕的时候出现了子宫内膜异位症，可以暂时不进行处理，在孕期，病情通常不会恶化。孕妇的身体会产生很多孕激素，这种激素会让疾病不会在妊娠中恶化，相反会导致其增长缓慢，甚至会发生收缩，如果子宫内膜异位症妊娠，可以通过生理疗法来控制。另外，如果出现了卵巢囊肿，如果没有明显的表现，可以不做任何的处理，如果出现了破裂或者急腹症，就应该及时就医。
首先，深静脉内异病的患者，为了防止复发，一般都会服用避孕药，另外，如果不想怀孕的话，可以通过上环来防止再次怀孕和避孕。
患者平时尽量不要吃油腻、辛辣、油腻、油腻、油腻、油腻的食品，多吃一些容易消化的食物，同时还要多吃一些新鲜的瓜果和蔬菜。手术后一个多月要尽量保持个人的干净和卫生，防止感染。尽量避免做过激烈的运动，比如散步、慢走等。
有些子宫内膜异位症的病人，如果怀孕了，可以通过怀孕消除宫腔中的病变坏死、萎缩，从而减轻分娩后的不适，甚至还有希望痊愈。
如果有需要的话，可以及早妊娠，这样才能有效地治愈。同时也要避免出现医源性的内膜植入。特别是在生产的时候，不管是做了剖腹产，又或者是做了什么手术。要注意切口周边，防止子宫内的东西流入腹腔，也不要做手术时做手术。另外，在缝好的时候要注意不要刺破子宫，在关腹之后要注意清洗腹腔，以免出现医源性的异位内膜移植。对于有子宫内膜异位症的女性，最好要做好准备，才能达到一定的效果。
