附件区的囊肿多见长在卵巢上，可根据大小、症状决定治疗方法，有药物治疗、观察和手术切除，手术可分为微创和开腹。如果开腹手术时间和微创手术时间基本一样，术中如果顺利，一般一小时左右。需要在月经干净后一周之内做，这样会避免出血。
卵巢囊肿的手术时间，按照麻醉好以后手术可能不会超过半个小时。有其他并发症状的时候，这种手术可能会延长时间，因为要处理其他的疾病。如果是卵巢畸胎瘤的情况下，有时候是必须通过病理切片来进行诊断的，发现异常情况时，既要采取局部组织的一并切除，避免恶性疾病的转移。
卵巢囊肿手术分为开腹手术和腹腔镜下手术两种方式。开腹手术，充分做好术前准备后，在手术室内，由麻醉师进行麻醉，麻醉效果出现后行手术治疗。剖开卵巢皮质后，轻轻地拨除卵巢囊肿，用3-0的可吸收肠线逐层缝合、闭合瘤腔，术中未见明显出血后行卵巢皮质内翻缝合卵巢成形术，手术中尽量多保留卵巢的皮质。巧克力囊肿术中黏连致密，可以行卵巢楔形切除术后，再行卵巢成形术。腹腔镜下手术只是创伤微小。
卵巢囊肿穿刺手术过程就是经阴道穿刺，然后吸出囊液，通常不需要住院，腹腔镜下手术是先放出囊液，然后再利用腹腔镜进行穿刺。卵巢囊肿穿刺手术主要包括经阴道超声下手术和腹腔镜下手术。
卵巢囊肿的微创手术，一般通过腹腔镜的方法进行处理，通过在女性腹部切口，引导腔镜到达女性的卵巢部位，针对囊肿进行手术剥离或穿刺，可以有效的改善卵巢囊肿的症状。
卵巢囊肿手术一般1-2小时左右，在妊娠期间发现，暂时可以不着急手术，可以过两个来月再做B超复查。如果复查以后还是这大，在月事干净三到七天之间进行手术切除。卵巢肿瘤是女性生殖器常见肿瘤，有各种不同的性质和形态。