可以采用药物治疗或手术治疗，减灭和去除病灶，缓解和消除疼痛，减少和避免复发。常用的药物治疗有，口服孕激素类药物的假孕疗法和假绝经疗法。手术治疗需要根据病人的年龄和有无生育要求来确定手术方式。
于子宫内膜异位症而言，治疗方式，就是需要手术治疗的，热敷，药物，的确是有效果，也且些中医的疗法，但是并不能从根本上解决问题的，而且手术是有一定的风险的，当然也不要轻易的进行手术，关键还是需要看个人的身体状况，确诊后这样才好治疗的，不能忽视这个事情。
剖宫产术后子宫内膜异位症是较常见的一个剖宫产术后的并发症，目前的治疗方法有手术与保守治疗两类。可以先可以服一些活血化瘀的中药，疼痛时对症治疗。严重时去医院根据检查结果进行手术治疗。
根治性手术：将子宫、双附件及盆腔内所有异位内膜病灶予以切除和清除，适用于45岁以上重症患者。保留卵巢功能手术：切除盆腔内病灶及子宫，保留至少一侧或部分卵巢。适用于III、IV期患者、症状明显且无生育要求的45岁以下患者。
子宫内膜异位症的手术应该是保留生育功能的手术，只是切除了异位内膜的病灶、分离粘连、恢复正常的解剖结构，保留了子宫和卵巢。这种手术，术后是可能复发的，复发率在40%左右，使用这种药物是较少复发的，如果不幸复发，治疗方法包括药物和再次手术。
子宫内膜异位症可以治好，但复发率较高。并且针对病人不同的就诊目的，其治疗方法也有相应改变。对于以怀孕为就诊目的的病人，根据其症状的严重程度决定术后是否使用药物治疗预防复发，然后再进行备孕，至病人怀孕则完成治疗。
