对于卵巢囊肿的治疗一般是通过手术治疗加上药物治疗，卵巢囊肿的治疗是需要时间的，近期三个月要小孩是不太可能的，如果进行手术的，就必须有个恢复期，然后再修养一下。平时也需要多多注意饮食方面的。
对良性、非赘生性、囊肿的直径大小在5厘米以内，又无任何症状的卵巢囊肿，不必作特殊处理，大部分可被机体吸收，自然消失。如果囊肿的大小超过5厘米，定期观察时有发展趋势，或囊肿发展快、增大明显，则应入院手术治疗。手术为卵巢囊肿切除术，输卵管卵巢切除术，附件及全子宫切除。
要看囊肿的大小，如果B超检查囊肿三四个厘米或者更小，应该是生理性的囊肿，是不需要治疗的，可以等下次月经后再做复查，生理性的囊肿会自然消失。如果目前检查超过五厘米，可以先做一下卵巢肿瘤标记物的检测再决定是否手术。
卵巢附件区的囊肿，如果是在5厘米以内可以暂时观察，可以在2次月经干净以后再重新复查。因为很多卵巢囊肿是功能性的，也就是有可能是卵泡囊肿或者黄体囊肿，一般2个月以后就会消失。如果观察2个月，囊肿继续增大或者没有消失，就是卵巢肿瘤，需要做手术。一定不要做剧烈活动，因为卵巢囊肿容易出现扭转。一旦出现扭转，必须要急诊做手术，会出现剧烈的腹痛，时间长了会引起卵巢的坏死，影响卵巢的功能。
卵巢囊肿破裂以后处理方法如下：
对于小的囊肿或单纯浆液性囊腺瘤破裂症状，患者此时可以随诊观察，一般无需特殊治疗，也可以适当应用抗生素预防感染；而对于大囊肿或畸胎瘤破裂的症状，患者常有剧烈腹痛，伴有恶心、呕吐，血压下降等症状，建议患者及时住院，完善相关化验，通过给予补液、抗休克、积极准备手术治疗等方式进行治疗，手术中尽量吸净囊液，并涂片行细胞学检查，明确诊断。