鲜胎的成功率略高一些。但成功与否也与进行试管婴儿手术时的技术者、特别是胚胎质量有关。鲜胚：取精子、卵子，进行培养，到第三天形成早期的胚胎，就是鲜胚。冻胚：将胚胎和冷冻液装入冷冻管中让胚胎静止下来并保存，用时再解冻，那么冷冻、解冻过程中会降低胚胎的活性，影响成功率。
冻胚成功率高。冻胚主要选择的是优质胚胎进行培育，女性在选择冻胚时就已经将身体调整到一个健康的状态，冻胚移植到宫腔内能够有一个较好的环境着床、生长发育，有利于试管婴儿的成功率。
试管婴儿移植冻胚和鲜胚成功率相当，冻胚和鲜胚并没有太大的优劣之分。有一部分人认为鲜胚由于未受到胚胎冷冻和复苏的干扰，能最大程度的保存其发育潜能，是最可靠的，其发育成功率也是较高的。
过去，医学认为未冷冻的新鲜胚胎的妊娠成功率相对较高，但近年的临床数据显示冷冻胚胎的妊娠成功率比新鲜胚胎高出约20-30%。胚胎冷冻后，两个月后子宫充分休息移植，怀孕的可能性更高。
冷冻胚胎移植和新鲜胚胎移植在成功率和活产率上几乎没有差异。研究人员发现37%接受冷冻胚胎移植的试管母亲成功植入，35%移植新鲜胚胎的试管母亲成功植入，两者之间没有显著差异，就活产率而言，接受冷冻胚胎移植的试管母亲的活产率为35%，接受新鲜胚胎移植的试管母亲的活产率为31%。
相对冻胚相对母体而言其成活率高，囊胚相对胎儿而言其成活率高，综合而言冻胚移植的成功率比较高。所以进行胚胎移植时将囊胚移植后会选择比较好的囊胚冷冻起来，冻胚只是保存囊胚的一种方式，并不会对细胞分化、囊胚发育造成影响。