治疗要明确是那种疾病再进行治疗，可以到正规医院内分泌科或外科就诊检查，根据病情采取激素类药物、手术、放疗等方法治疗。甲状腺-肾上腺皮质激素、性激素替代疗法，适用于全垂体功能衰退引起的多腺体功能减退者。垂体性闭经-手术和放射疗法垂体性闭经-食疗。
下丘脑垂体闭经需要先查明一下原因才能够对症治疗，如果是一些炎症的感染，导致的一些闭经，或者是激素水平不正常引起的闭经，都是需要查明一下原因，对症性的治疗，如果是一些激素的不正常，可以使用性激素促进激素的分泌。平时生活中一定要放松心情，不能够过度的紧张。
下丘脑垂体性闭经是由于下丘脑激素分泌异常导致的闭经。一定要在第一时间去治疗才行，可以尝试使用激素治疗的方法或者是药物治疗的方法，或者是中医针灸治疗的方法。平时注意卫生，避免辛辣刺激的食物。
脑垂体功能下降导致的闭经，可能是由于腺垂体激素分泌减少，引起卵巢激素分泌不足，导致垂体性闭经。可以补充外源性的激素进行治疗，或者用中医中药进行调理。中医多认为是由于肾精不足导致的，可以用补肾固精的中药治疗。
导致闭经最常见的原因是激素水平异常，青年人跟卵巢早衰有关系，不过可以通过药物控制，另外饮食方面可以多吃些补气血，有营养的食物，多进行户外活动调理心情，不要有太大的心里压力。