对于巧克力囊肿能需要治疗多久是要看个人的情况的，每个人的体质不同，时间也就不同。平时要注意自身保暖，经期，禁止激烈体育运动及重体力劳动，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累。情况严重时要手术进行治疗。
一般就是一年到两年左右。中医认为巧克力囊肿主要是由于气血亏虚，湿热邪气结聚所致，一般药物很难治好的。西医主要采取手术治疗，会造成一系列后遗症。中医中药长期临床实践积累了很多非常独特的治疗方法，奇效实用，省钱方便。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种，临床原则是手术治疗，现代医疗水平先进，可以不用开刀，直接用微创术，在腹部0.5CM小切口，入院到出院三至五天，将巧囊剥离，再在术中用药物及生物防粘膜，这样可以不再复发。
需要三个月左右才能治好。巧克力囊肿是子宫囊肿的一种，属于良性病变，会伴随有增生、转移、复发等情况的出现，而且会造成痛经、月经失调等，因此建议还是及早治疗比较好，需要服药三个月左右进行巩固治疗，另外需要随时复查。
巧克力囊肿手术治疗一个月左右就康复了。巧克力囊肿的手术治疗方法主要有：卵巢内膜囊肿液抽出术、内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保证正常卵巢和生育功能。术后一个月就能恢复正常生活。
这种病情一般的轻度的可以用药物治疗，严重的需要手术治疗。去当地正规三级甲等医院检查，针对病情合理的治疗，会恢复的很快。要饮食清淡，少食辛辣刺激的食物，保证充足的睡眠。