早期胚胎停育原是由于胚胎染色体异常。当存在胚胎停育的主要危险因素，包括胎儿父母的年龄较大，孕妇子宫畸形，盆腔感染与免疫病，弱危险因素包括既往自然流产史，不孕及辅助生殖，孕期药物使用，孕期咖啡因/吸烟/酒精暴露，肥胖，甲状腺功能不全等可能发生。
胚胎停育是因为一些生活的恶习而引起的，不改掉这些恶习，就算治疗以后，还是会复发的。胚胎停育是因为一些生活的恶习而引起的，不改掉这些恶习，胎停育一般是发生在孕早期，受精卵的质量不好就会出现停止继续生长。
胚胎停育的原因主要有四个方面。生殖内心泌方面，因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，分别是雌激素，孕激素，绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就满足不了胚胎的需要，就会造成胚胎的停育；生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育等。
胚胎停育的前兆主要有阴道出血、腹痛、妊娠反应逐渐停止、基础体温下降，如果处于孕中晚期，症状主要有胎动逐渐减少，没有胎动。孕期内分泌有问题也会直接影响到胚胎发育，因为受精卵着床发育成为胚胎，然后再发育成为胎儿，都需要黄体功能来维持，内分泌有问题，黄体酮分泌也会异常。
胚胎停止发育主要症状有停经史、下腹痛、阴道流血等。如果通过检查确定是胚胎停止发育，建议及时终止妊娠，胚胎停止发育处理比较困难，因为胚胎组织与子宫壁紧密粘连，刮宫困难，行药物流产。
胚胎染色体异常，如果父母一方染色体异常，胎儿染色体就可能出现异常，导致流产：染色体缺失，重叠，倒位以及平衡易位等，但这并不代表着夫妻双方染色体正常，胚胎染色体就一定没有问题。