内分泌失调。胚胎植入和持续发展依赖于复杂的内分泌系统相互协调，任何一个环节都可能导致流产。作为母亲，如果内源性激素不足，则不能满足胚胎的需要，并且可能导致胚胎悬浮和流产。
胚胎停育的原因有很多，具体原因现在医学也没有明确。影响胚胎发育的原因有很多，比如环境因素，饮食因素，情绪变化，或者是精子质量有问题，或者是有没有多囊卵巢综合症等。所以在下次怀孕后，一定要注意这些原因，都检查看看。
生殖内分泌方面，因为胚胎早期发育的时候，需要三个重要的激素水平，一个是雌激素，一个是孕激素，一个是绒毛膜促性腺激素，如果母体自身的内源性激素不够，就会造成胚胎的停育，生殖免疫的问题，如果自身有某种抗体，就会抵制胚胎的发育。
胎停育的因素比较常见的有：生殖内分泌方面(包括黄体不足，多囊卵巢)；男方精子质量的好坏子宫和卵巢功能的问题，子宫体积大小是否有畸形等；支原体衣原体的问题；是生殖免疫的问题等。
出现胚胎停育时乳房胀痛、恶心、干呕或尿频早孕反应会减轻或消失，其次可有阴道出血、腹部不适症状，但少数女性可没有典型的症状。胎停育是指胚胎发育到一个阶段发生了死亡而停止继续发育的现象。